Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R9

CCDC61, Coiled-coil domain-containing protein 61, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC61Q9Y6R9 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
CCDC61Q9Y6R9 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
CCDC61Q9Y6R9 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC34.99■■■■□ 3.19
CCDC61Q9Y6R9 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
CCDC61Q9Y6R9 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC34.99■■■■□ 3.19
CCDC61Q9Y6R9 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
CCDC61Q9Y6R9 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
CCDC61Q9Y6R9 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.97■■■■□ 3.19
CCDC61Q9Y6R9 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
CCDC61Q9Y6R9 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
CCDC61Q9Y6R9 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
CCDC61Q9Y6R9 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
CCDC61Q9Y6R9 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
CCDC61Q9Y6R9 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
CCDC61Q9Y6R9 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
CCDC61Q9Y6R9 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC34.95■■■■□ 3.19
CCDC61Q9Y6R9 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
CCDC61Q9Y6R9 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
CCDC61Q9Y6R9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
CCDC61Q9Y6R9 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
CCDC61Q9Y6R9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
CCDC61Q9Y6R9 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC34.94■■■■□ 3.18
CCDC61Q9Y6R9 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC34.94■■■■□ 3.18
CCDC61Q9Y6R9 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
CCDC61Q9Y6R9 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
CCDC61Q9Y6R9 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC34.94■■■■□ 3.18
CCDC61Q9Y6R9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
CCDC61Q9Y6R9 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
CCDC61Q9Y6R9 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
CCDC61Q9Y6R9 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
CCDC61Q9Y6R9 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
CCDC61Q9Y6R9 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC34.92■■■■□ 3.18
CCDC61Q9Y6R9 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
CCDC61Q9Y6R9 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
CCDC61Q9Y6R9 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
CCDC61Q9Y6R9 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
CCDC61Q9Y6R9 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
CCDC61Q9Y6R9 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
CCDC61Q9Y6R9 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
CCDC61Q9Y6R9 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC34.89■■■■□ 3.18
CCDC61Q9Y6R9 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC34.89■■■■□ 3.18
CCDC61Q9Y6R9 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
CCDC61Q9Y6R9 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
CCDC61Q9Y6R9 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
CCDC61Q9Y6R9 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
CCDC61Q9Y6R9 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
CCDC61Q9Y6R9 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
CCDC61Q9Y6R9 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
CCDC61Q9Y6R9 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
CCDC61Q9Y6R9 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
CCDC61Q9Y6R9 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC34.86■■■■□ 3.17
CCDC61Q9Y6R9 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC34.86■■■■□ 3.17
CCDC61Q9Y6R9 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
CCDC61Q9Y6R9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
CCDC61Q9Y6R9 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
CCDC61Q9Y6R9 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
CCDC61Q9Y6R9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
CCDC61Q9Y6R9 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
CCDC61Q9Y6R9 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
CCDC61Q9Y6R9 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
CCDC61Q9Y6R9 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
CCDC61Q9Y6R9 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.16
CCDC61Q9Y6R9 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC34.81■■■■□ 3.16
CCDC61Q9Y6R9 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
CCDC61Q9Y6R9 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
CCDC61Q9Y6R9 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
CCDC61Q9Y6R9 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC34.8■■■■□ 3.16
CCDC61Q9Y6R9 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
CCDC61Q9Y6R9 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
CCDC61Q9Y6R9 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
CCDC61Q9Y6R9 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC34.78■■■■□ 3.16
CCDC61Q9Y6R9 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
CCDC61Q9Y6R9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
CCDC61Q9Y6R9 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
CCDC61Q9Y6R9 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
CCDC61Q9Y6R9 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.15
CCDC61Q9Y6R9 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
CCDC61Q9Y6R9 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
CCDC61Q9Y6R9 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC34.75■■■■□ 3.15
CCDC61Q9Y6R9 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC34.74■■■■□ 3.15
CCDC61Q9Y6R9 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
CCDC61Q9Y6R9 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
CCDC61Q9Y6R9 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
CCDC61Q9Y6R9 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
CCDC61Q9Y6R9 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
CCDC61Q9Y6R9 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC34.74■■■■□ 3.15
CCDC61Q9Y6R9 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
CCDC61Q9Y6R9 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
CCDC61Q9Y6R9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
CCDC61Q9Y6R9 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC34.72■■■■□ 3.15
CCDC61Q9Y6R9 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
CCDC61Q9Y6R9 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
CCDC61Q9Y6R9 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
CCDC61Q9Y6R9 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
CCDC61Q9Y6R9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.15
CCDC61Q9Y6R9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
CCDC61Q9Y6R9 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
CCDC61Q9Y6R9 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC34.7■■■■□ 3.15
CCDC61Q9Y6R9 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC34.7■■■■□ 3.15
CCDC61Q9Y6R9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC34.7■■■■□ 3.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73 ms