Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y625

GPC6, Glypican-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC6Q9Y625 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GPC6Q9Y625 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GPC6Q9Y625 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GPC6Q9Y625 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GPC6Q9Y625 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GPC6Q9Y625 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GPC6Q9Y625 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
GPC6Q9Y625 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GPC6Q9Y625 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GPC6Q9Y625 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GPC6Q9Y625 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GPC6Q9Y625 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GPC6Q9Y625 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GPC6Q9Y625 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
GPC6Q9Y625 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GPC6Q9Y625 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GPC6Q9Y625 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GPC6Q9Y625 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GPC6Q9Y625 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GPC6Q9Y625 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GPC6Q9Y625 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GPC6Q9Y625 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GPC6Q9Y625 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GPC6Q9Y625 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GPC6Q9Y625 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
GPC6Q9Y625 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GPC6Q9Y625 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GPC6Q9Y625 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GPC6Q9Y625 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GPC6Q9Y625 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GPC6Q9Y625 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GPC6Q9Y625 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
GPC6Q9Y625 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GPC6Q9Y625 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GPC6Q9Y625 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GPC6Q9Y625 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GPC6Q9Y625 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GPC6Q9Y625 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
GPC6Q9Y625 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GPC6Q9Y625 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GPC6Q9Y625 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GPC6Q9Y625 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GPC6Q9Y625 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
GPC6Q9Y625 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GPC6Q9Y625 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GPC6Q9Y625 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GPC6Q9Y625 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GPC6Q9Y625 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.35
GPC6Q9Y625 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
GPC6Q9Y625 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GPC6Q9Y625 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
GPC6Q9Y625 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GPC6Q9Y625 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GPC6Q9Y625 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GPC6Q9Y625 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GPC6Q9Y625 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GPC6Q9Y625 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GPC6Q9Y625 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GPC6Q9Y625 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GPC6Q9Y625 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GPC6Q9Y625 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GPC6Q9Y625 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GPC6Q9Y625 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GPC6Q9Y625 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GPC6Q9Y625 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GPC6Q9Y625 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GPC6Q9Y625 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GPC6Q9Y625 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GPC6Q9Y625 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GPC6Q9Y625 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPC6Q9Y625 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPC6Q9Y625 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPC6Q9Y625 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPC6Q9Y625 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPC6Q9Y625 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPC6Q9Y625 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPC6Q9Y625 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GPC6Q9Y625 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GPC6Q9Y625 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GPC6Q9Y625 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GPC6Q9Y625 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GPC6Q9Y625 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GPC6Q9Y625 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GPC6Q9Y625 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GPC6Q9Y625 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GPC6Q9Y625 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GPC6Q9Y625 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GPC6Q9Y625 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GPC6Q9Y625 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GPC6Q9Y625 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GPC6Q9Y625 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GPC6Q9Y625 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GPC6Q9Y625 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GPC6Q9Y625 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GPC6Q9Y625 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GPC6Q9Y625 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GPC6Q9Y625 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GPC6Q9Y625 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GPC6Q9Y625 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GPC6Q9Y625 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.4 ms