Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Y9

SCN10A, Sodium channel protein type 10 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN10AQ9Y5Y9 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
SCN10AQ9Y5Y9 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SCN10AQ9Y5Y9 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SCN10AQ9Y5Y9 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SCN10AQ9Y5Y9 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SCN10AQ9Y5Y9 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SCN10AQ9Y5Y9 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SCN10AQ9Y5Y9 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
SCN10AQ9Y5Y9 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SCN10AQ9Y5Y9 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
SCN10AQ9Y5Y9 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SCN10AQ9Y5Y9 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
SCN10AQ9Y5Y9 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SCN10AQ9Y5Y9 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SCN10AQ9Y5Y9 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SCN10AQ9Y5Y9 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SCN10AQ9Y5Y9 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SCN10AQ9Y5Y9 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SCN10AQ9Y5Y9 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SCN10AQ9Y5Y9 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
SCN10AQ9Y5Y9 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SCN10AQ9Y5Y9 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SCN10AQ9Y5Y9 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SCN10AQ9Y5Y9 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
SCN10AQ9Y5Y9 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SCN10AQ9Y5Y9 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SCN10AQ9Y5Y9 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SCN10AQ9Y5Y9 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SCN10AQ9Y5Y9 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
SCN10AQ9Y5Y9 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SCN10AQ9Y5Y9 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SCN10AQ9Y5Y9 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SCN10AQ9Y5Y9 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SCN10AQ9Y5Y9 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SCN10AQ9Y5Y9 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SCN10AQ9Y5Y9 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SCN10AQ9Y5Y9 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SCN10AQ9Y5Y9 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SCN10AQ9Y5Y9 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SCN10AQ9Y5Y9 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SCN10AQ9Y5Y9 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SCN10AQ9Y5Y9 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SCN10AQ9Y5Y9 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SCN10AQ9Y5Y9 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SCN10AQ9Y5Y9 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SCN10AQ9Y5Y9 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SCN10AQ9Y5Y9 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SCN10AQ9Y5Y9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SCN10AQ9Y5Y9 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SCN10AQ9Y5Y9 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SCN10AQ9Y5Y9 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SCN10AQ9Y5Y9 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SCN10AQ9Y5Y9 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
SCN10AQ9Y5Y9 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SCN10AQ9Y5Y9 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SCN10AQ9Y5Y9 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SCN10AQ9Y5Y9 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SCN10AQ9Y5Y9 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SCN10AQ9Y5Y9 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SCN10AQ9Y5Y9 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
SCN10AQ9Y5Y9 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SCN10AQ9Y5Y9 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SCN10AQ9Y5Y9 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
SCN10AQ9Y5Y9 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SCN10AQ9Y5Y9 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SCN10AQ9Y5Y9 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SCN10AQ9Y5Y9 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SCN10AQ9Y5Y9 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
SCN10AQ9Y5Y9 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
SCN10AQ9Y5Y9 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SCN10AQ9Y5Y9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SCN10AQ9Y5Y9 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
SCN10AQ9Y5Y9 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SCN10AQ9Y5Y9 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SCN10AQ9Y5Y9 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SCN10AQ9Y5Y9 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SCN10AQ9Y5Y9 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SCN10AQ9Y5Y9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SCN10AQ9Y5Y9 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SCN10AQ9Y5Y9 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SCN10AQ9Y5Y9 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SCN10AQ9Y5Y9 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SCN10AQ9Y5Y9 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SCN10AQ9Y5Y9 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SCN10AQ9Y5Y9 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SCN10AQ9Y5Y9 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SCN10AQ9Y5Y9 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SCN10AQ9Y5Y9 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SCN10AQ9Y5Y9 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SCN10AQ9Y5Y9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SCN10AQ9Y5Y9 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
SCN10AQ9Y5Y9 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SCN10AQ9Y5Y9 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SCN10AQ9Y5Y9 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SCN10AQ9Y5Y9 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SCN10AQ9Y5Y9 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SCN10AQ9Y5Y9 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SCN10AQ9Y5Y9 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SCN10AQ9Y5Y9 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SCN10AQ9Y5Y9 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 290.5 ms