Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5J1

UTP18, U3 small nucleolar RNA-associated protein 18 homolog, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP18Q9Y5J1 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.561e-6■■■□□ 16.6
UTP18Q9Y5J1 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.551e-6■■■□□ 16.6
UTP18Q9Y5J1 TUFM-203ENST00000565012 966 ntTSL 518.4■□□□□ 0.541e-6■■■□□ 16.6
UTP18Q9Y5J1 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.431e-6■■■□□ 16.6
UTP18Q9Y5J1 SLC3A2-221ENST00000544377 589 ntTSL 417.6■□□□□ 0.411e-6■■■□□ 16.6
UTP18Q9Y5J1 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.391e-6■■■□□ 16.6
UTP18Q9Y5J1 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.271e-6■■■□□ 16.6
UTP18Q9Y5J1 SLC3A2-216ENST00000541372 269 ntTSL 516.43■□□□□ 0.221e-6■■■□□ 16.6
UTP18Q9Y5J1 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.161e-6■■■□□ 16.6
UTP18Q9Y5J1 SLC3A2-211ENST00000538084 741 ntTSL 315.6■□□□□ 0.091e-6■■■□□ 16.6
UTP18Q9Y5J1 AXIN2-209ENST00000618960 4060 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.031e-6■■■□□ 16.6
UTP18Q9Y5J1 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.519e-6■■■□□ 16.4
UTP18Q9Y5J1 MTA1-205ENST00000426567 568 ntTSL 314.99□□□□□ -0.013e-6■■■□□ 16.3
UTP18Q9Y5J1 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.983e-6■■■□□ 16.3
UTP18Q9Y5J1 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.843e-6■■■□□ 16.3
UTP18Q9Y5J1 CAMSAP3-204ENST00000595692 1667 ntTSL 229.24■■■□□ 2.273e-6■■■□□ 16.3
UTP18Q9Y5J1 NT5DC2-215ENST00000492555 2004 ntTSL 1 (best)19.78■□□□□ 0.763e-6■■■□□ 16.3
UTP18Q9Y5J1 NT5DC2-209ENST00000478091 590 ntTSL 319.34■□□□□ 0.693e-6■■■□□ 16.3
UTP18Q9Y5J1 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.363e-6■■■□□ 16.3
UTP18Q9Y5J1 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.33e-6■■■□□ 16.3
UTP18Q9Y5J1 NT5DC2-213ENST00000489316 772 ntTSL 516.85■□□□□ 0.293e-6■■■□□ 16.3
UTP18Q9Y5J1 EIF3B-210ENST00000468611 1868 ntTSL 216.48■□□□□ 0.233e-6■■■□□ 16.3
UTP18Q9Y5J1 EIF3B-207ENST00000465670 2766 ntTSL 215.73■□□□□ 0.113e-6■■■□□ 16.3
UTP18Q9Y5J1 CAMSAP3-201ENST00000160298 3889 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.023e-6■■■□□ 16.3
UTP18Q9Y5J1 CLTC-202ENST00000393043 5292 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.153e-6■■■□□ 16.3
UTP18Q9Y5J1 AL109613.1-203ENST00000417401 504 ntTSL 313.59□□□□□ -0.233e-6■■■□□ 16.3
UTP18Q9Y5J1 NT5DC2-201ENST00000307076 2047 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.283e-6■■■□□ 16.3
UTP18Q9Y5J1 CLTC-215ENST00000621829 8587 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.373e-6■■■□□ 16.3
UTP18Q9Y5J1 EIF3B-211ENST00000475415 3745 ntTSL 211.44□□□□□ -0.583e-6■■■□□ 16.3
UTP18Q9Y5J1 AL109613.1-205ENST00000446684 714 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.633e-6■■■□□ 16.3
UTP18Q9Y5J1 CLTC-201ENST00000269122 7760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.013e-6■■■□□ 16.3
UTP18Q9Y5J1 CLTC-210ENST00000579456 2301 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.23e-6■■■□□ 16.3
UTP18Q9Y5J1 CLTC-207ENST00000483176 760 ntTSL 35.59□□□□□ -1.513e-6■■■□□ 16.3
UTP18Q9Y5J1 AL109613.1-204ENST00000412628 172 ntTSL 35.11□□□□□ -1.593e-6■■■□□ 16.3
UTP18Q9Y5J1 ASPSCR1-217ENST00000583693 3976 ntTSL 214.38□□□□□ -0.119e-18■■■□□ 16.2
UTP18Q9Y5J1 ASPSCR1-215ENST00000583142 532 ntTSL 311.49□□□□□ -0.579e-18■■■□□ 16.2
UTP18Q9Y5J1 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.735e-7■■■□□ 16
UTP18Q9Y5J1 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.275e-7■■■□□ 16
UTP18Q9Y5J1 DSP-202ENST00000418664 7812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.373e-7■■■□□ 15.9
UTP18Q9Y5J1 DSP-201ENST00000379802 9796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.613e-7■■■□□ 15.9
UTP18Q9Y5J1 CWF19L1-206ENST00000478047 2694 ntTSL 211.89□□□□□ -0.516e-17■■■□□ 15.8
UTP18Q9Y5J1 CWF19L1-204ENST00000468709 2402 ntTSL 210.75□□□□□ -0.696e-17■■■□□ 15.8
UTP18Q9Y5J1 CWF19L1-201ENST00000354105 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.946e-17■■■□□ 15.8
UTP18Q9Y5J1 CWF19L1-207ENST00000482452 1606 ntTSL 57.14□□□□□ -1.276e-17■■■□□ 15.8
UTP18Q9Y5J1 RNF126-207ENST00000605891 1671 ntTSL 533.42■■■□□ 2.942e-6■■■□□ 15.7
UTP18Q9Y5J1 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.532e-6■■■□□ 15.7
UTP18Q9Y5J1 RNF126-203ENST00000589762 963 ntTSL 228.67■■■□□ 2.182e-6■■■□□ 15.7
UTP18Q9Y5J1 GUK1-218ENST00000469973 795 ntTSL 227.27■■□□□ 1.962e-6■■■□□ 15.7
UTP18Q9Y5J1 RNF126-205ENST00000591394 733 ntTSL 223.96■■□□□ 1.432e-6■■■□□ 15.7
UTP18Q9Y5J1 AC005726.2-201ENST00000481916 2091 ntTSL 1 (best)23.5■■□□□ 1.352e-6■■■□□ 15.7
UTP18Q9Y5J1 TMEM214-202ENST00000321326 2700 ntTSL 222.01■■□□□ 1.112e-6■■■□□ 15.7
UTP18Q9Y5J1 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.932e-6■■■□□ 15.7
UTP18Q9Y5J1 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.842e-6■■■□□ 15.7
UTP18Q9Y5J1 RNF126-204ENST00000590885 1436 ntTSL 519.83■□□□□ 0.762e-6■■■□□ 15.7
UTP18Q9Y5J1 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.722e-6■■■□□ 15.7
UTP18Q9Y5J1 RNF126-206ENST00000592626 652 ntTSL 219.51■□□□□ 0.712e-6■■■□□ 15.7
UTP18Q9Y5J1 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.42e-6■■■□□ 15.7
UTP18Q9Y5J1 TMEM214-206ENST00000435172 1480 ntTSL 516.84■□□□□ 0.292e-6■■■□□ 15.7
UTP18Q9Y5J1 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.142e-6■■■□□ 15.7
UTP18Q9Y5J1 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.012e-6■■■□□ 15.7
UTP18Q9Y5J1 ALDOC-209ENST00000584086 686 ntTSL 314.9□□□□□ -0.022e-6■■■□□ 15.7
UTP18Q9Y5J1 ALDOC-208ENST00000582381 571 ntTSL 213.92□□□□□ -0.182e-6■■■□□ 15.7
UTP18Q9Y5J1 TMEM214-211ENST00000475258 927 ntTSL 213.75□□□□□ -0.212e-6■■■□□ 15.7
UTP18Q9Y5J1 ALDOC-202ENST00000395319 1519 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.282e-6■■■□□ 15.7
UTP18Q9Y5J1 ALDOC-203ENST00000395321 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.332e-6■■■□□ 15.7
UTP18Q9Y5J1 ALDOC-207ENST00000581807 580 ntTSL 312.2□□□□□ -0.462e-6■■■□□ 15.7
UTP18Q9Y5J1 LRP1-201ENST00000243077 14897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.814e-9■■■□□ 15.6
UTP18Q9Y5J1 NOP58-203ENST00000433543 714 ntTSL 35.95□□□□□ -1.462e-7■■■□□ 15.6
UTP18Q9Y5J1 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.451e-7■■■□□ 15.6
UTP18Q9Y5J1 PPP1R12C-209ENST00000592993 2269 ntTSL 1 (best)22.93■■□□□ 1.261e-7■■■□□ 15.6
UTP18Q9Y5J1 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.951e-7■■■□□ 15.6
UTP18Q9Y5J1 SNORD4A-201ENST00000459174 72 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.441e-9■■■□□ 15.4
UTP18Q9Y5J1 FLNB-204ENST00000429972 9430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.449e-7■■■□□ 15.4
UTP18Q9Y5J1 FLNB-201ENST00000295956 9463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.449e-7■■■□□ 15.4
UTP18Q9Y5J1 FLNB-202ENST00000358537 9391 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.589e-7■■■□□ 15.4
UTP18Q9Y5J1 FLNB-214ENST00000493452 7402 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.659e-7■■■□□ 15.4
UTP18Q9Y5J1 FLNB-212ENST00000490882 8079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.79e-7■■■□□ 15.4
UTP18Q9Y5J1 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.962e-6■■■□□ 15.2
UTP18Q9Y5J1 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.762e-6■■■□□ 15.2
UTP18Q9Y5J1 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.042e-22■■■□□ 15.2
UTP18Q9Y5J1 TSR1-203ENST00000575049 387 ntTSL 34.91□□□□□ -1.622e-22■■■□□ 15.2
UTP18Q9Y5J1 TRIR-204ENST00000591254 988 ntTSL 226.75■■□□□ 1.876e-6■■■□□ 15.1
UTP18Q9Y5J1 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.456e-6■■■□□ 15.1
UTP18Q9Y5J1 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.46e-6■■■□□ 15.1
UTP18Q9Y5J1 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.376e-6■■■□□ 15.1
UTP18Q9Y5J1 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.336e-6■■■□□ 15.1
UTP18Q9Y5J1 FOXK2-202ENST00000473637 3462 ntTSL 1 (best)21.72■■□□□ 1.076e-6■■■□□ 15.1
UTP18Q9Y5J1 FOXK2-205ENST00000529652 2199 ntTSL 217.79■□□□□ 0.446e-6■■■□□ 15.1
UTP18Q9Y5J1 FLNA-216ENST00000490936 5374 ntTSL 1 (best)17.74■□□□□ 0.436e-6■■■□□ 15.1
UTP18Q9Y5J1 LAMA5-213ENST00000497053 723 ntTSL 316.25■□□□□ 0.196e-6■■■□□ 15.1
UTP18Q9Y5J1 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.136e-6■■■□□ 15.1
UTP18Q9Y5J1 FOXK2-209ENST00000571989 573 ntTSL 515.38■□□□□ 0.056e-6■■■□□ 15.1
UTP18Q9Y5J1 PRR12-201ENST00000418929 6955 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.036e-6■■■□□ 15.1
UTP18Q9Y5J1 FOXK2-212ENST00000624186 4244 nt13.79□□□□□ -0.26e-6■■■□□ 15.1
UTP18Q9Y5J1 PRPF6-201ENST00000266079 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.266e-6■■■□□ 15.1
UTP18Q9Y5J1 UBR4-204ENST00000375254 15906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.262e-6■■■□□ 14.9
UTP18Q9Y5J1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.842e-6■■■□□ 14.8
UTP18Q9Y5J1 LARP1-211ENST00000521577 817 ntTSL 526.38■■□□□ 1.812e-6■■■□□ 14.8
UTP18Q9Y5J1 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.242e-6■■■□□ 14.8
UTP18Q9Y5J1 LARP1-204ENST00000518297 2630 ntTSL 522.5■■□□□ 1.192e-6■■■□□ 14.8
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