Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5F0

PCDHB13, Protocadherin beta-13, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB13Q9Y5F0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PCDHB13Q9Y5F0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PCDHB13Q9Y5F0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PCDHB13Q9Y5F0 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PCDHB13Q9Y5F0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PCDHB13Q9Y5F0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PCDHB13Q9Y5F0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
PCDHB13Q9Y5F0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PCDHB13Q9Y5F0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PCDHB13Q9Y5F0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PCDHB13Q9Y5F0 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
PCDHB13Q9Y5F0 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
PCDHB13Q9Y5F0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PCDHB13Q9Y5F0 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PCDHB13Q9Y5F0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PCDHB13Q9Y5F0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PCDHB13Q9Y5F0 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PCDHB13Q9Y5F0 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
PCDHB13Q9Y5F0 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PCDHB13Q9Y5F0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PCDHB13Q9Y5F0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PCDHB13Q9Y5F0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PCDHB13Q9Y5F0 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PCDHB13Q9Y5F0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
PCDHB13Q9Y5F0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
PCDHB13Q9Y5F0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PCDHB13Q9Y5F0 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PCDHB13Q9Y5F0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PCDHB13Q9Y5F0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PCDHB13Q9Y5F0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PCDHB13Q9Y5F0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PCDHB13Q9Y5F0 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PCDHB13Q9Y5F0 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
PCDHB13Q9Y5F0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PCDHB13Q9Y5F0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PCDHB13Q9Y5F0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PCDHB13Q9Y5F0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PCDHB13Q9Y5F0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PCDHB13Q9Y5F0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PCDHB13Q9Y5F0 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PCDHB13Q9Y5F0 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
PCDHB13Q9Y5F0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PCDHB13Q9Y5F0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PCDHB13Q9Y5F0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PCDHB13Q9Y5F0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PCDHB13Q9Y5F0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PCDHB13Q9Y5F0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PCDHB13Q9Y5F0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PCDHB13Q9Y5F0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PCDHB13Q9Y5F0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PCDHB13Q9Y5F0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PCDHB13Q9Y5F0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PCDHB13Q9Y5F0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PCDHB13Q9Y5F0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PCDHB13Q9Y5F0 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PCDHB13Q9Y5F0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PCDHB13Q9Y5F0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PCDHB13Q9Y5F0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PCDHB13Q9Y5F0 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PCDHB13Q9Y5F0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PCDHB13Q9Y5F0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PCDHB13Q9Y5F0 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PCDHB13Q9Y5F0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PCDHB13Q9Y5F0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PCDHB13Q9Y5F0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PCDHB13Q9Y5F0 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PCDHB13Q9Y5F0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PCDHB13Q9Y5F0 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
PCDHB13Q9Y5F0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.01
PCDHB13Q9Y5F0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PCDHB13Q9Y5F0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PCDHB13Q9Y5F0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PCDHB13Q9Y5F0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PCDHB13Q9Y5F0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PCDHB13Q9Y5F0 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PCDHB13Q9Y5F0 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
PCDHB13Q9Y5F0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PCDHB13Q9Y5F0 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PCDHB13Q9Y5F0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PCDHB13Q9Y5F0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PCDHB13Q9Y5F0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PCDHB13Q9Y5F0 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PCDHB13Q9Y5F0 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PCDHB13Q9Y5F0 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
PCDHB13Q9Y5F0 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PCDHB13Q9Y5F0 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PCDHB13Q9Y5F0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PCDHB13Q9Y5F0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
PCDHB13Q9Y5F0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PCDHB13Q9Y5F0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PCDHB13Q9Y5F0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PCDHB13Q9Y5F0 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PCDHB13Q9Y5F0 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.56■■■□□ 2
PCDHB13Q9Y5F0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PCDHB13Q9Y5F0 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PCDHB13Q9Y5F0 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PCDHB13Q9Y5F0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PCDHB13Q9Y5F0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PCDHB13Q9Y5F0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PCDHB13Q9Y5F0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms