Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5E7

PCDHB2, Protocadherin beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB2Q9Y5E7 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PCDHB2Q9Y5E7 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PCDHB2Q9Y5E7 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PCDHB2Q9Y5E7 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PCDHB2Q9Y5E7 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
PCDHB2Q9Y5E7 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PCDHB2Q9Y5E7 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PCDHB2Q9Y5E7 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PCDHB2Q9Y5E7 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PCDHB2Q9Y5E7 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
PCDHB2Q9Y5E7 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PCDHB2Q9Y5E7 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PCDHB2Q9Y5E7 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PCDHB2Q9Y5E7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PCDHB2Q9Y5E7 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PCDHB2Q9Y5E7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PCDHB2Q9Y5E7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PCDHB2Q9Y5E7 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PCDHB2Q9Y5E7 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PCDHB2Q9Y5E7 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
PCDHB2Q9Y5E7 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PCDHB2Q9Y5E7 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PCDHB2Q9Y5E7 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
PCDHB2Q9Y5E7 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PCDHB2Q9Y5E7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PCDHB2Q9Y5E7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PCDHB2Q9Y5E7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PCDHB2Q9Y5E7 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PCDHB2Q9Y5E7 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
PCDHB2Q9Y5E7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PCDHB2Q9Y5E7 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PCDHB2Q9Y5E7 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PCDHB2Q9Y5E7 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PCDHB2Q9Y5E7 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PCDHB2Q9Y5E7 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PCDHB2Q9Y5E7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PCDHB2Q9Y5E7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PCDHB2Q9Y5E7 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PCDHB2Q9Y5E7 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PCDHB2Q9Y5E7 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PCDHB2Q9Y5E7 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PCDHB2Q9Y5E7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PCDHB2Q9Y5E7 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PCDHB2Q9Y5E7 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PCDHB2Q9Y5E7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PCDHB2Q9Y5E7 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
PCDHB2Q9Y5E7 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PCDHB2Q9Y5E7 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PCDHB2Q9Y5E7 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PCDHB2Q9Y5E7 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PCDHB2Q9Y5E7 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PCDHB2Q9Y5E7 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PCDHB2Q9Y5E7 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PCDHB2Q9Y5E7 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.56■■■□□ 2
PCDHB2Q9Y5E7 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PCDHB2Q9Y5E7 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PCDHB2Q9Y5E7 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
PCDHB2Q9Y5E7 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PCDHB2Q9Y5E7 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PCDHB2Q9Y5E7 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PCDHB2Q9Y5E7 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PCDHB2Q9Y5E7 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PCDHB2Q9Y5E7 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PCDHB2Q9Y5E7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PCDHB2Q9Y5E7 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PCDHB2Q9Y5E7 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PCDHB2Q9Y5E7 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PCDHB2Q9Y5E7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
PCDHB2Q9Y5E7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PCDHB2Q9Y5E7 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PCDHB2Q9Y5E7 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PCDHB2Q9Y5E7 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PCDHB2Q9Y5E7 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PCDHB2Q9Y5E7 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
PCDHB2Q9Y5E7 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PCDHB2Q9Y5E7 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PCDHB2Q9Y5E7 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PCDHB2Q9Y5E7 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PCDHB2Q9Y5E7 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PCDHB2Q9Y5E7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PCDHB2Q9Y5E7 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PCDHB2Q9Y5E7 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PCDHB2Q9Y5E7 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PCDHB2Q9Y5E7 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PCDHB2Q9Y5E7 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PCDHB2Q9Y5E7 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PCDHB2Q9Y5E7 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PCDHB2Q9Y5E7 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PCDHB2Q9Y5E7 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PCDHB2Q9Y5E7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PCDHB2Q9Y5E7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PCDHB2Q9Y5E7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PCDHB2Q9Y5E7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PCDHB2Q9Y5E7 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PCDHB2Q9Y5E7 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PCDHB2Q9Y5E7 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PCDHB2Q9Y5E7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
PCDHB2Q9Y5E7 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PCDHB2Q9Y5E7 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PCDHB2Q9Y5E7 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms