Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D8

HECTD4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HECTD4, humanhuman

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Length 3,996 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD4Q9Y4D8 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
HECTD4Q9Y4D8 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HECTD4Q9Y4D8 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
HECTD4Q9Y4D8 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HECTD4Q9Y4D8 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HECTD4Q9Y4D8 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
HECTD4Q9Y4D8 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
HECTD4Q9Y4D8 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HECTD4Q9Y4D8 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HECTD4Q9Y4D8 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HECTD4Q9Y4D8 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HECTD4Q9Y4D8 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
HECTD4Q9Y4D8 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HECTD4Q9Y4D8 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HECTD4Q9Y4D8 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HECTD4Q9Y4D8 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
HECTD4Q9Y4D8 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HECTD4Q9Y4D8 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HECTD4Q9Y4D8 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
HECTD4Q9Y4D8 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HECTD4Q9Y4D8 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
HECTD4Q9Y4D8 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC16.83■□□□□ 0.29
HECTD4Q9Y4D8 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HECTD4Q9Y4D8 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HECTD4Q9Y4D8 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HECTD4Q9Y4D8 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HECTD4Q9Y4D8 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HECTD4Q9Y4D8 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HECTD4Q9Y4D8 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HECTD4Q9Y4D8 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HECTD4Q9Y4D8 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HECTD4Q9Y4D8 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HECTD4Q9Y4D8 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HECTD4Q9Y4D8 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HECTD4Q9Y4D8 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HECTD4Q9Y4D8 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HECTD4Q9Y4D8 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HECTD4Q9Y4D8 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HECTD4Q9Y4D8 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HECTD4Q9Y4D8 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HECTD4Q9Y4D8 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HECTD4Q9Y4D8 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HECTD4Q9Y4D8 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HECTD4Q9Y4D8 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
HECTD4Q9Y4D8 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HECTD4Q9Y4D8 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
HECTD4Q9Y4D8 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
HECTD4Q9Y4D8 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HECTD4Q9Y4D8 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HECTD4Q9Y4D8 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HECTD4Q9Y4D8 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HECTD4Q9Y4D8 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HECTD4Q9Y4D8 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HECTD4Q9Y4D8 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HECTD4Q9Y4D8 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HECTD4Q9Y4D8 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HECTD4Q9Y4D8 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HECTD4Q9Y4D8 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
HECTD4Q9Y4D8 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HECTD4Q9Y4D8 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HECTD4Q9Y4D8 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
HECTD4Q9Y4D8 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HECTD4Q9Y4D8 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HECTD4Q9Y4D8 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HECTD4Q9Y4D8 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HECTD4Q9Y4D8 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HECTD4Q9Y4D8 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HECTD4Q9Y4D8 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
HECTD4Q9Y4D8 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
HECTD4Q9Y4D8 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HECTD4Q9Y4D8 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HECTD4Q9Y4D8 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HECTD4Q9Y4D8 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HECTD4Q9Y4D8 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HECTD4Q9Y4D8 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HECTD4Q9Y4D8 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HECTD4Q9Y4D8 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
HECTD4Q9Y4D8 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HECTD4Q9Y4D8 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HECTD4Q9Y4D8 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HECTD4Q9Y4D8 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
HECTD4Q9Y4D8 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HECTD4Q9Y4D8 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HECTD4Q9Y4D8 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HECTD4Q9Y4D8 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HECTD4Q9Y4D8 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HECTD4Q9Y4D8 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HECTD4Q9Y4D8 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HECTD4Q9Y4D8 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
HECTD4Q9Y4D8 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HECTD4Q9Y4D8 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HECTD4Q9Y4D8 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HECTD4Q9Y4D8 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HECTD4Q9Y4D8 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HECTD4Q9Y4D8 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HECTD4Q9Y4D8 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HECTD4Q9Y4D8 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HECTD4Q9Y4D8 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
HECTD4Q9Y4D8 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HECTD4Q9Y4D8 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 886.3 ms