Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3R5

DOPEY2, Protein dopey-2, humanhuman

Predictions only

Length 2,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DOPEY2Q9Y3R5 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DOPEY2Q9Y3R5 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DOPEY2Q9Y3R5 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
DOPEY2Q9Y3R5 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
DOPEY2Q9Y3R5 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DOPEY2Q9Y3R5 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DOPEY2Q9Y3R5 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
DOPEY2Q9Y3R5 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DOPEY2Q9Y3R5 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DOPEY2Q9Y3R5 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DOPEY2Q9Y3R5 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DOPEY2Q9Y3R5 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DOPEY2Q9Y3R5 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
DOPEY2Q9Y3R5 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DOPEY2Q9Y3R5 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
DOPEY2Q9Y3R5 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DOPEY2Q9Y3R5 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DOPEY2Q9Y3R5 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DOPEY2Q9Y3R5 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DOPEY2Q9Y3R5 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DOPEY2Q9Y3R5 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DOPEY2Q9Y3R5 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DOPEY2Q9Y3R5 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DOPEY2Q9Y3R5 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DOPEY2Q9Y3R5 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DOPEY2Q9Y3R5 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DOPEY2Q9Y3R5 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DOPEY2Q9Y3R5 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
DOPEY2Q9Y3R5 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DOPEY2Q9Y3R5 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DOPEY2Q9Y3R5 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DOPEY2Q9Y3R5 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DOPEY2Q9Y3R5 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DOPEY2Q9Y3R5 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DOPEY2Q9Y3R5 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DOPEY2Q9Y3R5 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DOPEY2Q9Y3R5 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
DOPEY2Q9Y3R5 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DOPEY2Q9Y3R5 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DOPEY2Q9Y3R5 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
DOPEY2Q9Y3R5 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DOPEY2Q9Y3R5 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DOPEY2Q9Y3R5 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DOPEY2Q9Y3R5 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DOPEY2Q9Y3R5 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DOPEY2Q9Y3R5 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DOPEY2Q9Y3R5 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DOPEY2Q9Y3R5 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DOPEY2Q9Y3R5 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
DOPEY2Q9Y3R5 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DOPEY2Q9Y3R5 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DOPEY2Q9Y3R5 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DOPEY2Q9Y3R5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DOPEY2Q9Y3R5 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DOPEY2Q9Y3R5 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DOPEY2Q9Y3R5 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DOPEY2Q9Y3R5 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DOPEY2Q9Y3R5 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DOPEY2Q9Y3R5 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DOPEY2Q9Y3R5 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DOPEY2Q9Y3R5 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DOPEY2Q9Y3R5 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DOPEY2Q9Y3R5 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
DOPEY2Q9Y3R5 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DOPEY2Q9Y3R5 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.16
DOPEY2Q9Y3R5 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
DOPEY2Q9Y3R5 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DOPEY2Q9Y3R5 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DOPEY2Q9Y3R5 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DOPEY2Q9Y3R5 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DOPEY2Q9Y3R5 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DOPEY2Q9Y3R5 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DOPEY2Q9Y3R5 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
DOPEY2Q9Y3R5 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DOPEY2Q9Y3R5 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
DOPEY2Q9Y3R5 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DOPEY2Q9Y3R5 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DOPEY2Q9Y3R5 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DOPEY2Q9Y3R5 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DOPEY2Q9Y3R5 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
DOPEY2Q9Y3R5 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DOPEY2Q9Y3R5 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DOPEY2Q9Y3R5 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DOPEY2Q9Y3R5 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DOPEY2Q9Y3R5 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DOPEY2Q9Y3R5 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DOPEY2Q9Y3R5 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DOPEY2Q9Y3R5 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DOPEY2Q9Y3R5 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
DOPEY2Q9Y3R5 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DOPEY2Q9Y3R5 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DOPEY2Q9Y3R5 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DOPEY2Q9Y3R5 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DOPEY2Q9Y3R5 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
DOPEY2Q9Y3R5 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DOPEY2Q9Y3R5 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DOPEY2Q9Y3R5 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DOPEY2Q9Y3R5 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DOPEY2Q9Y3R5 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
DOPEY2Q9Y3R5 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms