Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Q3

TMED3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED3Q9Y3Q3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
TMED3Q9Y3Q3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMED3Q9Y3Q3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMED3Q9Y3Q3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMED3Q9Y3Q3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMED3Q9Y3Q3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMED3Q9Y3Q3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMED3Q9Y3Q3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMED3Q9Y3Q3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMED3Q9Y3Q3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMED3Q9Y3Q3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMED3Q9Y3Q3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMED3Q9Y3Q3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMED3Q9Y3Q3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMED3Q9Y3Q3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMED3Q9Y3Q3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMED3Q9Y3Q3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMED3Q9Y3Q3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMED3Q9Y3Q3 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMED3Q9Y3Q3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMED3Q9Y3Q3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMED3Q9Y3Q3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMED3Q9Y3Q3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMED3Q9Y3Q3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMED3Q9Y3Q3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMED3Q9Y3Q3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMED3Q9Y3Q3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMED3Q9Y3Q3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMED3Q9Y3Q3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMED3Q9Y3Q3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMED3Q9Y3Q3 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMED3Q9Y3Q3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMED3Q9Y3Q3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMED3Q9Y3Q3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMED3Q9Y3Q3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMED3Q9Y3Q3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMED3Q9Y3Q3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMED3Q9Y3Q3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMED3Q9Y3Q3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMED3Q9Y3Q3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMED3Q9Y3Q3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMED3Q9Y3Q3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMED3Q9Y3Q3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMED3Q9Y3Q3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMED3Q9Y3Q3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMED3Q9Y3Q3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMED3Q9Y3Q3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMED3Q9Y3Q3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMED3Q9Y3Q3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMED3Q9Y3Q3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TMED3Q9Y3Q3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMED3Q9Y3Q3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMED3Q9Y3Q3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMED3Q9Y3Q3 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMED3Q9Y3Q3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMED3Q9Y3Q3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMED3Q9Y3Q3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMED3Q9Y3Q3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMED3Q9Y3Q3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMED3Q9Y3Q3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMED3Q9Y3Q3 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMED3Q9Y3Q3 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMED3Q9Y3Q3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMED3Q9Y3Q3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMED3Q9Y3Q3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMED3Q9Y3Q3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMED3Q9Y3Q3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMED3Q9Y3Q3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMED3Q9Y3Q3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMED3Q9Y3Q3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMED3Q9Y3Q3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMED3Q9Y3Q3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMED3Q9Y3Q3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMED3Q9Y3Q3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMED3Q9Y3Q3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMED3Q9Y3Q3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
TMED3Q9Y3Q3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMED3Q9Y3Q3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMED3Q9Y3Q3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMED3Q9Y3Q3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMED3Q9Y3Q3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMED3Q9Y3Q3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMED3Q9Y3Q3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMED3Q9Y3Q3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMED3Q9Y3Q3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMED3Q9Y3Q3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMED3Q9Y3Q3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMED3Q9Y3Q3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMED3Q9Y3Q3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMED3Q9Y3Q3 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMED3Q9Y3Q3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMED3Q9Y3Q3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMED3Q9Y3Q3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMED3Q9Y3Q3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMED3Q9Y3Q3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMED3Q9Y3Q3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMED3Q9Y3Q3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMED3Q9Y3Q3 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMED3Q9Y3Q3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMED3Q9Y3Q3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms