Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A6

TMED5, Transmembrane emp24 domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED5Q9Y3A6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMED5Q9Y3A6 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TMED5Q9Y3A6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMED5Q9Y3A6 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMED5Q9Y3A6 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMED5Q9Y3A6 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMED5Q9Y3A6 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMED5Q9Y3A6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMED5Q9Y3A6 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMED5Q9Y3A6 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMED5Q9Y3A6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMED5Q9Y3A6 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TMED5Q9Y3A6 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TMED5Q9Y3A6 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TMED5Q9Y3A6 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMED5Q9Y3A6 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMED5Q9Y3A6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMED5Q9Y3A6 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMED5Q9Y3A6 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMED5Q9Y3A6 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMED5Q9Y3A6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMED5Q9Y3A6 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMED5Q9Y3A6 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMED5Q9Y3A6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMED5Q9Y3A6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMED5Q9Y3A6 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMED5Q9Y3A6 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMED5Q9Y3A6 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMED5Q9Y3A6 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMED5Q9Y3A6 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMED5Q9Y3A6 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMED5Q9Y3A6 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMED5Q9Y3A6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMED5Q9Y3A6 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMED5Q9Y3A6 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMED5Q9Y3A6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMED5Q9Y3A6 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMED5Q9Y3A6 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMED5Q9Y3A6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMED5Q9Y3A6 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMED5Q9Y3A6 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMED5Q9Y3A6 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMED5Q9Y3A6 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMED5Q9Y3A6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMED5Q9Y3A6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMED5Q9Y3A6 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMED5Q9Y3A6 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMED5Q9Y3A6 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMED5Q9Y3A6 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMED5Q9Y3A6 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TMED5Q9Y3A6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMED5Q9Y3A6 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TMED5Q9Y3A6 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TMED5Q9Y3A6 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMED5Q9Y3A6 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMED5Q9Y3A6 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMED5Q9Y3A6 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMED5Q9Y3A6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TMED5Q9Y3A6 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMED5Q9Y3A6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMED5Q9Y3A6 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMED5Q9Y3A6 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMED5Q9Y3A6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMED5Q9Y3A6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMED5Q9Y3A6 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMED5Q9Y3A6 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMED5Q9Y3A6 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
TMED5Q9Y3A6 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMED5Q9Y3A6 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMED5Q9Y3A6 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMED5Q9Y3A6 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMED5Q9Y3A6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMED5Q9Y3A6 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMED5Q9Y3A6 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMED5Q9Y3A6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMED5Q9Y3A6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMED5Q9Y3A6 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMED5Q9Y3A6 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMED5Q9Y3A6 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMED5Q9Y3A6 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMED5Q9Y3A6 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMED5Q9Y3A6 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMED5Q9Y3A6 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMED5Q9Y3A6 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMED5Q9Y3A6 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMED5Q9Y3A6 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMED5Q9Y3A6 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMED5Q9Y3A6 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMED5Q9Y3A6 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TMED5Q9Y3A6 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMED5Q9Y3A6 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TMED5Q9Y3A6 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMED5Q9Y3A6 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMED5Q9Y3A6 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMED5Q9Y3A6 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMED5Q9Y3A6 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMED5Q9Y3A6 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMED5Q9Y3A6 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMED5Q9Y3A6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TMED5Q9Y3A6 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms