Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y333

LSM2, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM2Q9Y333 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LSM2Q9Y333 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LSM2Q9Y333 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LSM2Q9Y333 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LSM2Q9Y333 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LSM2Q9Y333 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LSM2Q9Y333 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LSM2Q9Y333 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LSM2Q9Y333 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LSM2Q9Y333 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LSM2Q9Y333 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LSM2Q9Y333 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LSM2Q9Y333 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LSM2Q9Y333 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LSM2Q9Y333 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LSM2Q9Y333 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LSM2Q9Y333 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LSM2Q9Y333 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LSM2Q9Y333 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LSM2Q9Y333 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LSM2Q9Y333 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LSM2Q9Y333 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LSM2Q9Y333 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LSM2Q9Y333 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LSM2Q9Y333 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LSM2Q9Y333 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LSM2Q9Y333 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LSM2Q9Y333 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LSM2Q9Y333 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LSM2Q9Y333 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LSM2Q9Y333 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LSM2Q9Y333 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LSM2Q9Y333 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LSM2Q9Y333 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LSM2Q9Y333 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LSM2Q9Y333 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LSM2Q9Y333 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
LSM2Q9Y333 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LSM2Q9Y333 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LSM2Q9Y333 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LSM2Q9Y333 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LSM2Q9Y333 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LSM2Q9Y333 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LSM2Q9Y333 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LSM2Q9Y333 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LSM2Q9Y333 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LSM2Q9Y333 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LSM2Q9Y333 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LSM2Q9Y333 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LSM2Q9Y333 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LSM2Q9Y333 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LSM2Q9Y333 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LSM2Q9Y333 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LSM2Q9Y333 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
LSM2Q9Y333 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LSM2Q9Y333 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LSM2Q9Y333 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LSM2Q9Y333 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LSM2Q9Y333 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LSM2Q9Y333 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LSM2Q9Y333 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LSM2Q9Y333 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LSM2Q9Y333 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LSM2Q9Y333 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LSM2Q9Y333 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LSM2Q9Y333 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LSM2Q9Y333 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LSM2Q9Y333 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LSM2Q9Y333 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LSM2Q9Y333 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LSM2Q9Y333 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LSM2Q9Y333 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LSM2Q9Y333 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LSM2Q9Y333 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LSM2Q9Y333 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LSM2Q9Y333 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LSM2Q9Y333 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LSM2Q9Y333 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LSM2Q9Y333 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LSM2Q9Y333 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LSM2Q9Y333 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LSM2Q9Y333 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LSM2Q9Y333 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LSM2Q9Y333 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LSM2Q9Y333 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LSM2Q9Y333 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LSM2Q9Y333 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LSM2Q9Y333 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LSM2Q9Y333 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LSM2Q9Y333 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LSM2Q9Y333 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LSM2Q9Y333 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LSM2Q9Y333 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LSM2Q9Y333 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LSM2Q9Y333 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LSM2Q9Y333 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LSM2Q9Y333 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
LSM2Q9Y333 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LSM2Q9Y333 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LSM2Q9Y333 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.6 ms