Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2T2

AP3M1, AP-3 complex subunit mu-1, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M1Q9Y2T2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
AP3M1Q9Y2T2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
AP3M1Q9Y2T2 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
AP3M1Q9Y2T2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
AP3M1Q9Y2T2 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
AP3M1Q9Y2T2 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
AP3M1Q9Y2T2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
AP3M1Q9Y2T2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
AP3M1Q9Y2T2 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
AP3M1Q9Y2T2 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
AP3M1Q9Y2T2 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
AP3M1Q9Y2T2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
AP3M1Q9Y2T2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
AP3M1Q9Y2T2 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
AP3M1Q9Y2T2 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
AP3M1Q9Y2T2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
AP3M1Q9Y2T2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
AP3M1Q9Y2T2 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
AP3M1Q9Y2T2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
AP3M1Q9Y2T2 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
AP3M1Q9Y2T2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
AP3M1Q9Y2T2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
AP3M1Q9Y2T2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
AP3M1Q9Y2T2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
AP3M1Q9Y2T2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
AP3M1Q9Y2T2 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
AP3M1Q9Y2T2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
AP3M1Q9Y2T2 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
AP3M1Q9Y2T2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
AP3M1Q9Y2T2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
AP3M1Q9Y2T2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
AP3M1Q9Y2T2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
AP3M1Q9Y2T2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
AP3M1Q9Y2T2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
AP3M1Q9Y2T2 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
AP3M1Q9Y2T2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
AP3M1Q9Y2T2 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
AP3M1Q9Y2T2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
AP3M1Q9Y2T2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
AP3M1Q9Y2T2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
AP3M1Q9Y2T2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
AP3M1Q9Y2T2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
AP3M1Q9Y2T2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
AP3M1Q9Y2T2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AP3M1Q9Y2T2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AP3M1Q9Y2T2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AP3M1Q9Y2T2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
AP3M1Q9Y2T2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
AP3M1Q9Y2T2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
AP3M1Q9Y2T2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
AP3M1Q9Y2T2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
AP3M1Q9Y2T2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AP3M1Q9Y2T2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
AP3M1Q9Y2T2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AP3M1Q9Y2T2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AP3M1Q9Y2T2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AP3M1Q9Y2T2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AP3M1Q9Y2T2 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AP3M1Q9Y2T2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AP3M1Q9Y2T2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AP3M1Q9Y2T2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
AP3M1Q9Y2T2 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
AP3M1Q9Y2T2 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AP3M1Q9Y2T2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AP3M1Q9Y2T2 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
AP3M1Q9Y2T2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
AP3M1Q9Y2T2 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AP3M1Q9Y2T2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
AP3M1Q9Y2T2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AP3M1Q9Y2T2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
AP3M1Q9Y2T2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AP3M1Q9Y2T2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AP3M1Q9Y2T2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AP3M1Q9Y2T2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
AP3M1Q9Y2T2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
AP3M1Q9Y2T2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AP3M1Q9Y2T2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
AP3M1Q9Y2T2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AP3M1Q9Y2T2 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
AP3M1Q9Y2T2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AP3M1Q9Y2T2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
AP3M1Q9Y2T2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AP3M1Q9Y2T2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AP3M1Q9Y2T2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
AP3M1Q9Y2T2 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
AP3M1Q9Y2T2 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
AP3M1Q9Y2T2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AP3M1Q9Y2T2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AP3M1Q9Y2T2 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
AP3M1Q9Y2T2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AP3M1Q9Y2T2 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AP3M1Q9Y2T2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AP3M1Q9Y2T2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AP3M1Q9Y2T2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
AP3M1Q9Y2T2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AP3M1Q9Y2T2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AP3M1Q9Y2T2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
AP3M1Q9Y2T2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
AP3M1Q9Y2T2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AP3M1Q9Y2T2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms