Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2H6

FNDC3A, Fibronectin type-III domain-containing protein 3A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC3AQ9Y2H6 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
FNDC3AQ9Y2H6 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FNDC3AQ9Y2H6 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FNDC3AQ9Y2H6 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FNDC3AQ9Y2H6 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FNDC3AQ9Y2H6 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FNDC3AQ9Y2H6 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FNDC3AQ9Y2H6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
FNDC3AQ9Y2H6 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
FNDC3AQ9Y2H6 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
FNDC3AQ9Y2H6 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
FNDC3AQ9Y2H6 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
FNDC3AQ9Y2H6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
FNDC3AQ9Y2H6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FNDC3AQ9Y2H6 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
FNDC3AQ9Y2H6 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
FNDC3AQ9Y2H6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
FNDC3AQ9Y2H6 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
FNDC3AQ9Y2H6 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
FNDC3AQ9Y2H6 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
FNDC3AQ9Y2H6 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
FNDC3AQ9Y2H6 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FNDC3AQ9Y2H6 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FNDC3AQ9Y2H6 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FNDC3AQ9Y2H6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FNDC3AQ9Y2H6 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FNDC3AQ9Y2H6 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FNDC3AQ9Y2H6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FNDC3AQ9Y2H6 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
FNDC3AQ9Y2H6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FNDC3AQ9Y2H6 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FNDC3AQ9Y2H6 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
FNDC3AQ9Y2H6 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FNDC3AQ9Y2H6 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FNDC3AQ9Y2H6 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FNDC3AQ9Y2H6 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FNDC3AQ9Y2H6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FNDC3AQ9Y2H6 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FNDC3AQ9Y2H6 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FNDC3AQ9Y2H6 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FNDC3AQ9Y2H6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FNDC3AQ9Y2H6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FNDC3AQ9Y2H6 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FNDC3AQ9Y2H6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FNDC3AQ9Y2H6 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FNDC3AQ9Y2H6 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FNDC3AQ9Y2H6 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FNDC3AQ9Y2H6 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FNDC3AQ9Y2H6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FNDC3AQ9Y2H6 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FNDC3AQ9Y2H6 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FNDC3AQ9Y2H6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FNDC3AQ9Y2H6 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FNDC3AQ9Y2H6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FNDC3AQ9Y2H6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FNDC3AQ9Y2H6 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FNDC3AQ9Y2H6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FNDC3AQ9Y2H6 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FNDC3AQ9Y2H6 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
FNDC3AQ9Y2H6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FNDC3AQ9Y2H6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FNDC3AQ9Y2H6 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
FNDC3AQ9Y2H6 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
FNDC3AQ9Y2H6 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FNDC3AQ9Y2H6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FNDC3AQ9Y2H6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FNDC3AQ9Y2H6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FNDC3AQ9Y2H6 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FNDC3AQ9Y2H6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FNDC3AQ9Y2H6 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FNDC3AQ9Y2H6 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FNDC3AQ9Y2H6 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FNDC3AQ9Y2H6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FNDC3AQ9Y2H6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FNDC3AQ9Y2H6 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FNDC3AQ9Y2H6 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FNDC3AQ9Y2H6 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FNDC3AQ9Y2H6 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FNDC3AQ9Y2H6 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FNDC3AQ9Y2H6 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
FNDC3AQ9Y2H6 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FNDC3AQ9Y2H6 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FNDC3AQ9Y2H6 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
FNDC3AQ9Y2H6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FNDC3AQ9Y2H6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FNDC3AQ9Y2H6 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FNDC3AQ9Y2H6 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FNDC3AQ9Y2H6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FNDC3AQ9Y2H6 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FNDC3AQ9Y2H6 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FNDC3AQ9Y2H6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FNDC3AQ9Y2H6 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
FNDC3AQ9Y2H6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
FNDC3AQ9Y2H6 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
FNDC3AQ9Y2H6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FNDC3AQ9Y2H6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FNDC3AQ9Y2H6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
FNDC3AQ9Y2H6 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FNDC3AQ9Y2H6 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FNDC3AQ9Y2H6 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.9 ms