Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2D8

SSX2IP, Afadin- and alpha-actinin-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX2IPQ9Y2D8 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
SSX2IPQ9Y2D8 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SSX2IPQ9Y2D8 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SSX2IPQ9Y2D8 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SSX2IPQ9Y2D8 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SSX2IPQ9Y2D8 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
SSX2IPQ9Y2D8 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SSX2IPQ9Y2D8 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SSX2IPQ9Y2D8 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SSX2IPQ9Y2D8 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SSX2IPQ9Y2D8 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SSX2IPQ9Y2D8 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SSX2IPQ9Y2D8 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SSX2IPQ9Y2D8 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SSX2IPQ9Y2D8 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SSX2IPQ9Y2D8 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SSX2IPQ9Y2D8 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SSX2IPQ9Y2D8 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SSX2IPQ9Y2D8 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SSX2IPQ9Y2D8 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
SSX2IPQ9Y2D8 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SSX2IPQ9Y2D8 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SSX2IPQ9Y2D8 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SSX2IPQ9Y2D8 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SSX2IPQ9Y2D8 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SSX2IPQ9Y2D8 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SSX2IPQ9Y2D8 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SSX2IPQ9Y2D8 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SSX2IPQ9Y2D8 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SSX2IPQ9Y2D8 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SSX2IPQ9Y2D8 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SSX2IPQ9Y2D8 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SSX2IPQ9Y2D8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SSX2IPQ9Y2D8 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SSX2IPQ9Y2D8 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SSX2IPQ9Y2D8 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SSX2IPQ9Y2D8 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SSX2IPQ9Y2D8 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
SSX2IPQ9Y2D8 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SSX2IPQ9Y2D8 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SSX2IPQ9Y2D8 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SSX2IPQ9Y2D8 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SSX2IPQ9Y2D8 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SSX2IPQ9Y2D8 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SSX2IPQ9Y2D8 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SSX2IPQ9Y2D8 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
SSX2IPQ9Y2D8 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SSX2IPQ9Y2D8 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SSX2IPQ9Y2D8 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SSX2IPQ9Y2D8 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
SSX2IPQ9Y2D8 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SSX2IPQ9Y2D8 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
SSX2IPQ9Y2D8 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SSX2IPQ9Y2D8 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SSX2IPQ9Y2D8 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SSX2IPQ9Y2D8 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SSX2IPQ9Y2D8 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SSX2IPQ9Y2D8 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SSX2IPQ9Y2D8 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SSX2IPQ9Y2D8 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SSX2IPQ9Y2D8 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SSX2IPQ9Y2D8 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SSX2IPQ9Y2D8 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SSX2IPQ9Y2D8 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SSX2IPQ9Y2D8 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SSX2IPQ9Y2D8 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SSX2IPQ9Y2D8 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SSX2IPQ9Y2D8 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
SSX2IPQ9Y2D8 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
SSX2IPQ9Y2D8 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SSX2IPQ9Y2D8 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SSX2IPQ9Y2D8 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SSX2IPQ9Y2D8 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SSX2IPQ9Y2D8 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SSX2IPQ9Y2D8 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SSX2IPQ9Y2D8 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SSX2IPQ9Y2D8 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SSX2IPQ9Y2D8 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
SSX2IPQ9Y2D8 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SSX2IPQ9Y2D8 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SSX2IPQ9Y2D8 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SSX2IPQ9Y2D8 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SSX2IPQ9Y2D8 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SSX2IPQ9Y2D8 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SSX2IPQ9Y2D8 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SSX2IPQ9Y2D8 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SSX2IPQ9Y2D8 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
SSX2IPQ9Y2D8 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SSX2IPQ9Y2D8 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SSX2IPQ9Y2D8 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SSX2IPQ9Y2D8 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SSX2IPQ9Y2D8 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SSX2IPQ9Y2D8 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SSX2IPQ9Y2D8 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
SSX2IPQ9Y2D8 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SSX2IPQ9Y2D8 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
SSX2IPQ9Y2D8 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
SSX2IPQ9Y2D8 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SSX2IPQ9Y2D8 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SSX2IPQ9Y2D8 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms