Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2B5

VPS9D1, VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS9D1Q9Y2B5 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
VPS9D1Q9Y2B5 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VPS9D1Q9Y2B5 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VPS9D1Q9Y2B5 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
VPS9D1Q9Y2B5 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
VPS9D1Q9Y2B5 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
VPS9D1Q9Y2B5 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VPS9D1Q9Y2B5 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VPS9D1Q9Y2B5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VPS9D1Q9Y2B5 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VPS9D1Q9Y2B5 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
VPS9D1Q9Y2B5 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VPS9D1Q9Y2B5 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
VPS9D1Q9Y2B5 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
VPS9D1Q9Y2B5 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VPS9D1Q9Y2B5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
VPS9D1Q9Y2B5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
VPS9D1Q9Y2B5 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
VPS9D1Q9Y2B5 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
VPS9D1Q9Y2B5 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
VPS9D1Q9Y2B5 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
VPS9D1Q9Y2B5 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
VPS9D1Q9Y2B5 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
VPS9D1Q9Y2B5 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
VPS9D1Q9Y2B5 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
VPS9D1Q9Y2B5 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VPS9D1Q9Y2B5 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VPS9D1Q9Y2B5 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
VPS9D1Q9Y2B5 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
VPS9D1Q9Y2B5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VPS9D1Q9Y2B5 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VPS9D1Q9Y2B5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VPS9D1Q9Y2B5 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
VPS9D1Q9Y2B5 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VPS9D1Q9Y2B5 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VPS9D1Q9Y2B5 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VPS9D1Q9Y2B5 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VPS9D1Q9Y2B5 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VPS9D1Q9Y2B5 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VPS9D1Q9Y2B5 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VPS9D1Q9Y2B5 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
VPS9D1Q9Y2B5 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VPS9D1Q9Y2B5 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
VPS9D1Q9Y2B5 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
VPS9D1Q9Y2B5 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
VPS9D1Q9Y2B5 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
VPS9D1Q9Y2B5 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
VPS9D1Q9Y2B5 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
VPS9D1Q9Y2B5 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
VPS9D1Q9Y2B5 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
VPS9D1Q9Y2B5 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
VPS9D1Q9Y2B5 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
VPS9D1Q9Y2B5 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
VPS9D1Q9Y2B5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
VPS9D1Q9Y2B5 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
VPS9D1Q9Y2B5 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
VPS9D1Q9Y2B5 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
VPS9D1Q9Y2B5 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
VPS9D1Q9Y2B5 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
VPS9D1Q9Y2B5 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
VPS9D1Q9Y2B5 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
VPS9D1Q9Y2B5 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
VPS9D1Q9Y2B5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
VPS9D1Q9Y2B5 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VPS9D1Q9Y2B5 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VPS9D1Q9Y2B5 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
VPS9D1Q9Y2B5 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VPS9D1Q9Y2B5 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
VPS9D1Q9Y2B5 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VPS9D1Q9Y2B5 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
VPS9D1Q9Y2B5 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VPS9D1Q9Y2B5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VPS9D1Q9Y2B5 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VPS9D1Q9Y2B5 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VPS9D1Q9Y2B5 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VPS9D1Q9Y2B5 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
VPS9D1Q9Y2B5 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
VPS9D1Q9Y2B5 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
VPS9D1Q9Y2B5 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
VPS9D1Q9Y2B5 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
VPS9D1Q9Y2B5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
VPS9D1Q9Y2B5 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VPS9D1Q9Y2B5 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VPS9D1Q9Y2B5 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VPS9D1Q9Y2B5 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VPS9D1Q9Y2B5 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VPS9D1Q9Y2B5 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
VPS9D1Q9Y2B5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VPS9D1Q9Y2B5 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
VPS9D1Q9Y2B5 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
VPS9D1Q9Y2B5 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VPS9D1Q9Y2B5 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
VPS9D1Q9Y2B5 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
VPS9D1Q9Y2B5 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
VPS9D1Q9Y2B5 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VPS9D1Q9Y2B5 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VPS9D1Q9Y2B5 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
VPS9D1Q9Y2B5 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
VPS9D1Q9Y2B5 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VPS9D1Q9Y2B5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms