Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y248

GINS2, DNA replication complex GINS protein PSF2, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS2Q9Y248 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
GINS2Q9Y248 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GINS2Q9Y248 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GINS2Q9Y248 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GINS2Q9Y248 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GINS2Q9Y248 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GINS2Q9Y248 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GINS2Q9Y248 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GINS2Q9Y248 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GINS2Q9Y248 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GINS2Q9Y248 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GINS2Q9Y248 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GINS2Q9Y248 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
GINS2Q9Y248 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GINS2Q9Y248 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
GINS2Q9Y248 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
GINS2Q9Y248 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
GINS2Q9Y248 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GINS2Q9Y248 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
GINS2Q9Y248 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GINS2Q9Y248 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GINS2Q9Y248 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GINS2Q9Y248 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GINS2Q9Y248 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GINS2Q9Y248 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GINS2Q9Y248 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GINS2Q9Y248 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
GINS2Q9Y248 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GINS2Q9Y248 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GINS2Q9Y248 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
GINS2Q9Y248 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
GINS2Q9Y248 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
GINS2Q9Y248 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GINS2Q9Y248 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
GINS2Q9Y248 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
GINS2Q9Y248 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GINS2Q9Y248 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GINS2Q9Y248 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
GINS2Q9Y248 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GINS2Q9Y248 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GINS2Q9Y248 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
GINS2Q9Y248 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
GINS2Q9Y248 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
GINS2Q9Y248 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
GINS2Q9Y248 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GINS2Q9Y248 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
GINS2Q9Y248 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
GINS2Q9Y248 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
GINS2Q9Y248 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GINS2Q9Y248 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GINS2Q9Y248 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GINS2Q9Y248 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GINS2Q9Y248 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GINS2Q9Y248 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GINS2Q9Y248 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GINS2Q9Y248 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
GINS2Q9Y248 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
GINS2Q9Y248 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
GINS2Q9Y248 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
GINS2Q9Y248 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
GINS2Q9Y248 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GINS2Q9Y248 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GINS2Q9Y248 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GINS2Q9Y248 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
GINS2Q9Y248 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GINS2Q9Y248 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GINS2Q9Y248 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
GINS2Q9Y248 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GINS2Q9Y248 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GINS2Q9Y248 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GINS2Q9Y248 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GINS2Q9Y248 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GINS2Q9Y248 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
GINS2Q9Y248 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GINS2Q9Y248 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GINS2Q9Y248 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GINS2Q9Y248 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GINS2Q9Y248 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GINS2Q9Y248 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GINS2Q9Y248 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GINS2Q9Y248 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GINS2Q9Y248 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GINS2Q9Y248 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
GINS2Q9Y248 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
GINS2Q9Y248 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
GINS2Q9Y248 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GINS2Q9Y248 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GINS2Q9Y248 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GINS2Q9Y248 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GINS2Q9Y248 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
GINS2Q9Y248 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GINS2Q9Y248 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GINS2Q9Y248 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GINS2Q9Y248 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GINS2Q9Y248 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GINS2Q9Y248 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GINS2Q9Y248 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GINS2Q9Y248 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GINS2Q9Y248 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GINS2Q9Y248 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms