Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y239

NOD1, Nucleotide-binding oligomerization domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOD1Q9Y239 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NOD1Q9Y239 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NOD1Q9Y239 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NOD1Q9Y239 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NOD1Q9Y239 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NOD1Q9Y239 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NOD1Q9Y239 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NOD1Q9Y239 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NOD1Q9Y239 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NOD1Q9Y239 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NOD1Q9Y239 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NOD1Q9Y239 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NOD1Q9Y239 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NOD1Q9Y239 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NOD1Q9Y239 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NOD1Q9Y239 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NOD1Q9Y239 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NOD1Q9Y239 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NOD1Q9Y239 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NOD1Q9Y239 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
NOD1Q9Y239 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NOD1Q9Y239 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NOD1Q9Y239 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NOD1Q9Y239 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NOD1Q9Y239 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NOD1Q9Y239 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NOD1Q9Y239 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NOD1Q9Y239 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NOD1Q9Y239 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
NOD1Q9Y239 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NOD1Q9Y239 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NOD1Q9Y239 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NOD1Q9Y239 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NOD1Q9Y239 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NOD1Q9Y239 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
NOD1Q9Y239 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NOD1Q9Y239 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NOD1Q9Y239 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NOD1Q9Y239 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NOD1Q9Y239 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
NOD1Q9Y239 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NOD1Q9Y239 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
NOD1Q9Y239 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NOD1Q9Y239 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
NOD1Q9Y239 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NOD1Q9Y239 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NOD1Q9Y239 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
NOD1Q9Y239 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NOD1Q9Y239 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NOD1Q9Y239 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
NOD1Q9Y239 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NOD1Q9Y239 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NOD1Q9Y239 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NOD1Q9Y239 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NOD1Q9Y239 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NOD1Q9Y239 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NOD1Q9Y239 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NOD1Q9Y239 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NOD1Q9Y239 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
NOD1Q9Y239 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NOD1Q9Y239 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
NOD1Q9Y239 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NOD1Q9Y239 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NOD1Q9Y239 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NOD1Q9Y239 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NOD1Q9Y239 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
NOD1Q9Y239 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NOD1Q9Y239 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
NOD1Q9Y239 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NOD1Q9Y239 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NOD1Q9Y239 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NOD1Q9Y239 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NOD1Q9Y239 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NOD1Q9Y239 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NOD1Q9Y239 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NOD1Q9Y239 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NOD1Q9Y239 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NOD1Q9Y239 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
NOD1Q9Y239 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NOD1Q9Y239 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NOD1Q9Y239 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NOD1Q9Y239 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NOD1Q9Y239 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NOD1Q9Y239 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NOD1Q9Y239 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NOD1Q9Y239 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NOD1Q9Y239 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NOD1Q9Y239 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NOD1Q9Y239 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NOD1Q9Y239 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NOD1Q9Y239 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NOD1Q9Y239 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NOD1Q9Y239 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NOD1Q9Y239 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NOD1Q9Y239 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NOD1Q9Y239 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NOD1Q9Y239 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NOD1Q9Y239 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NOD1Q9Y239 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NOD1Q9Y239 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms