Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y235

APOBEC2, C->U-editing enzyme APOBEC-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC2Q9Y235 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
APOBEC2Q9Y235 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
APOBEC2Q9Y235 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
APOBEC2Q9Y235 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
APOBEC2Q9Y235 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
APOBEC2Q9Y235 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
APOBEC2Q9Y235 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
APOBEC2Q9Y235 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
APOBEC2Q9Y235 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
APOBEC2Q9Y235 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
APOBEC2Q9Y235 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
APOBEC2Q9Y235 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
APOBEC2Q9Y235 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
APOBEC2Q9Y235 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
APOBEC2Q9Y235 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
APOBEC2Q9Y235 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
APOBEC2Q9Y235 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
APOBEC2Q9Y235 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
APOBEC2Q9Y235 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
APOBEC2Q9Y235 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
APOBEC2Q9Y235 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
APOBEC2Q9Y235 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
APOBEC2Q9Y235 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
APOBEC2Q9Y235 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
APOBEC2Q9Y235 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
APOBEC2Q9Y235 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
APOBEC2Q9Y235 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
APOBEC2Q9Y235 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
APOBEC2Q9Y235 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
APOBEC2Q9Y235 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
APOBEC2Q9Y235 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
APOBEC2Q9Y235 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
APOBEC2Q9Y235 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
APOBEC2Q9Y235 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
APOBEC2Q9Y235 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
APOBEC2Q9Y235 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
APOBEC2Q9Y235 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
APOBEC2Q9Y235 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
APOBEC2Q9Y235 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
APOBEC2Q9Y235 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
APOBEC2Q9Y235 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
APOBEC2Q9Y235 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
APOBEC2Q9Y235 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
APOBEC2Q9Y235 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
APOBEC2Q9Y235 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
APOBEC2Q9Y235 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
APOBEC2Q9Y235 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
APOBEC2Q9Y235 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
APOBEC2Q9Y235 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
APOBEC2Q9Y235 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
APOBEC2Q9Y235 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
APOBEC2Q9Y235 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
APOBEC2Q9Y235 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
APOBEC2Q9Y235 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
APOBEC2Q9Y235 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
APOBEC2Q9Y235 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
APOBEC2Q9Y235 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
APOBEC2Q9Y235 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
APOBEC2Q9Y235 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
APOBEC2Q9Y235 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
APOBEC2Q9Y235 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
APOBEC2Q9Y235 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
APOBEC2Q9Y235 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
APOBEC2Q9Y235 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
APOBEC2Q9Y235 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
APOBEC2Q9Y235 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
APOBEC2Q9Y235 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
APOBEC2Q9Y235 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
APOBEC2Q9Y235 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
APOBEC2Q9Y235 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
APOBEC2Q9Y235 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
APOBEC2Q9Y235 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
APOBEC2Q9Y235 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
APOBEC2Q9Y235 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
APOBEC2Q9Y235 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
APOBEC2Q9Y235 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
APOBEC2Q9Y235 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
APOBEC2Q9Y235 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
APOBEC2Q9Y235 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
APOBEC2Q9Y235 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
APOBEC2Q9Y235 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
APOBEC2Q9Y235 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
APOBEC2Q9Y235 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
APOBEC2Q9Y235 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
APOBEC2Q9Y235 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
APOBEC2Q9Y235 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
APOBEC2Q9Y235 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
APOBEC2Q9Y235 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
APOBEC2Q9Y235 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
APOBEC2Q9Y235 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
APOBEC2Q9Y235 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
APOBEC2Q9Y235 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
APOBEC2Q9Y235 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
APOBEC2Q9Y235 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
APOBEC2Q9Y235 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
APOBEC2Q9Y235 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
APOBEC2Q9Y235 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
APOBEC2Q9Y235 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
APOBEC2Q9Y235 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
APOBEC2Q9Y235 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms