Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV27

Atp1a4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1a4Q9WV27 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Atp1a4Q9WV27 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Atp1a4Q9WV27 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Atp1a4Q9WV27 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Atp1a4Q9WV27 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Atp1a4Q9WV27 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Atp1a4Q9WV27 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Atp1a4Q9WV27 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Atp1a4Q9WV27 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Atp1a4Q9WV27 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Atp1a4Q9WV27 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Atp1a4Q9WV27 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Atp1a4Q9WV27 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Atp1a4Q9WV27 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Atp1a4Q9WV27 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Atp1a4Q9WV27 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Atp1a4Q9WV27 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Atp1a4Q9WV27 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Atp1a4Q9WV27 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Atp1a4Q9WV27 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Atp1a4Q9WV27 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Atp1a4Q9WV27 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Atp1a4Q9WV27 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Atp1a4Q9WV27 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Atp1a4Q9WV27 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Atp1a4Q9WV27 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Atp1a4Q9WV27 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Atp1a4Q9WV27 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Atp1a4Q9WV27 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Atp1a4Q9WV27 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Atp1a4Q9WV27 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Atp1a4Q9WV27 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Atp1a4Q9WV27 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Atp1a4Q9WV27 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Atp1a4Q9WV27 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Atp1a4Q9WV27 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Atp1a4Q9WV27 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Atp1a4Q9WV27 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Atp1a4Q9WV27 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Atp1a4Q9WV27 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Atp1a4Q9WV27 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Atp1a4Q9WV27 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Atp1a4Q9WV27 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Atp1a4Q9WV27 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Atp1a4Q9WV27 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Atp1a4Q9WV27 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Atp1a4Q9WV27 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Atp1a4Q9WV27 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Atp1a4Q9WV27 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Atp1a4Q9WV27 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Atp1a4Q9WV27 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Atp1a4Q9WV27 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Atp1a4Q9WV27 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Atp1a4Q9WV27 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Atp1a4Q9WV27 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Atp1a4Q9WV27 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Atp1a4Q9WV27 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Atp1a4Q9WV27 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Atp1a4Q9WV27 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Atp1a4Q9WV27 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Atp1a4Q9WV27 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Atp1a4Q9WV27 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Atp1a4Q9WV27 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Atp1a4Q9WV27 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Atp1a4Q9WV27 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Atp1a4Q9WV27 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Atp1a4Q9WV27 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Atp1a4Q9WV27 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Atp1a4Q9WV27 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Atp1a4Q9WV27 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Atp1a4Q9WV27 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Atp1a4Q9WV27 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Atp1a4Q9WV27 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Atp1a4Q9WV27 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Atp1a4Q9WV27 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Atp1a4Q9WV27 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Atp1a4Q9WV27 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Atp1a4Q9WV27 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Atp1a4Q9WV27 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Atp1a4Q9WV27 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Atp1a4Q9WV27 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Atp1a4Q9WV27 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Atp1a4Q9WV27 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Atp1a4Q9WV27 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Atp1a4Q9WV27 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Atp1a4Q9WV27 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Atp1a4Q9WV27 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Atp1a4Q9WV27 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Atp1a4Q9WV27 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Atp1a4Q9WV27 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Atp1a4Q9WV27 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Atp1a4Q9WV27 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Atp1a4Q9WV27 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Atp1a4Q9WV27 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Atp1a4Q9WV27 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Atp1a4Q9WV27 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Atp1a4Q9WV27 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Atp1a4Q9WV27 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Atp1a4Q9WV27 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Atp1a4Q9WV27 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.2 ms