Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV18

Gabbr1, Gamma-aminobutyric acid type B receptor subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabbr1Q9WV18 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Gabbr1Q9WV18 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gabbr1Q9WV18 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gabbr1Q9WV18 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gabbr1Q9WV18 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gabbr1Q9WV18 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gabbr1Q9WV18 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gabbr1Q9WV18 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gabbr1Q9WV18 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gabbr1Q9WV18 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gabbr1Q9WV18 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gabbr1Q9WV18 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gabbr1Q9WV18 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gabbr1Q9WV18 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gabbr1Q9WV18 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Gabbr1Q9WV18 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gabbr1Q9WV18 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gabbr1Q9WV18 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gabbr1Q9WV18 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gabbr1Q9WV18 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gabbr1Q9WV18 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gabbr1Q9WV18 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gabbr1Q9WV18 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Gabbr1Q9WV18 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gabbr1Q9WV18 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gabbr1Q9WV18 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gabbr1Q9WV18 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gabbr1Q9WV18 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gabbr1Q9WV18 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gabbr1Q9WV18 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gabbr1Q9WV18 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gabbr1Q9WV18 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gabbr1Q9WV18 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gabbr1Q9WV18 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gabbr1Q9WV18 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gabbr1Q9WV18 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gabbr1Q9WV18 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gabbr1Q9WV18 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gabbr1Q9WV18 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gabbr1Q9WV18 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gabbr1Q9WV18 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gabbr1Q9WV18 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gabbr1Q9WV18 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gabbr1Q9WV18 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gabbr1Q9WV18 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gabbr1Q9WV18 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gabbr1Q9WV18 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gabbr1Q9WV18 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Gabbr1Q9WV18 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Gabbr1Q9WV18 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gabbr1Q9WV18 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gabbr1Q9WV18 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gabbr1Q9WV18 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gabbr1Q9WV18 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gabbr1Q9WV18 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gabbr1Q9WV18 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gabbr1Q9WV18 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gabbr1Q9WV18 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gabbr1Q9WV18 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gabbr1Q9WV18 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gabbr1Q9WV18 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gabbr1Q9WV18 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gabbr1Q9WV18 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gabbr1Q9WV18 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gabbr1Q9WV18 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gabbr1Q9WV18 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gabbr1Q9WV18 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gabbr1Q9WV18 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gabbr1Q9WV18 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gabbr1Q9WV18 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gabbr1Q9WV18 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gabbr1Q9WV18 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gabbr1Q9WV18 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gabbr1Q9WV18 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gabbr1Q9WV18 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gabbr1Q9WV18 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gabbr1Q9WV18 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gabbr1Q9WV18 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Gabbr1Q9WV18 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Gabbr1Q9WV18 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gabbr1Q9WV18 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gabbr1Q9WV18 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gabbr1Q9WV18 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gabbr1Q9WV18 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gabbr1Q9WV18 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gabbr1Q9WV18 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gabbr1Q9WV18 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gabbr1Q9WV18 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gabbr1Q9WV18 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gabbr1Q9WV18 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gabbr1Q9WV18 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gabbr1Q9WV18 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gabbr1Q9WV18 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gabbr1Q9WV18 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gabbr1Q9WV18 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gabbr1Q9WV18 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gabbr1Q9WV18 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gabbr1Q9WV18 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gabbr1Q9WV18 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gabbr1Q9WV18 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms