Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUP4

Srd5a3, Polyprenol reductase, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srd5a3Q9WUP4 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Srd5a3Q9WUP4 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Srd5a3Q9WUP4 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Srd5a3Q9WUP4 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Srd5a3Q9WUP4 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Srd5a3Q9WUP4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Srd5a3Q9WUP4 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Srd5a3Q9WUP4 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Srd5a3Q9WUP4 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Srd5a3Q9WUP4 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Srd5a3Q9WUP4 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Srd5a3Q9WUP4 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Srd5a3Q9WUP4 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Srd5a3Q9WUP4 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Srd5a3Q9WUP4 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Srd5a3Q9WUP4 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Srd5a3Q9WUP4 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Srd5a3Q9WUP4 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Srd5a3Q9WUP4 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Srd5a3Q9WUP4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Srd5a3Q9WUP4 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Srd5a3Q9WUP4 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Srd5a3Q9WUP4 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Srd5a3Q9WUP4 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Srd5a3Q9WUP4 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Srd5a3Q9WUP4 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Srd5a3Q9WUP4 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Srd5a3Q9WUP4 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Srd5a3Q9WUP4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Srd5a3Q9WUP4 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Srd5a3Q9WUP4 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Srd5a3Q9WUP4 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Srd5a3Q9WUP4 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Srd5a3Q9WUP4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Srd5a3Q9WUP4 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Srd5a3Q9WUP4 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Srd5a3Q9WUP4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Srd5a3Q9WUP4 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Srd5a3Q9WUP4 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Srd5a3Q9WUP4 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Srd5a3Q9WUP4 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Srd5a3Q9WUP4 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Srd5a3Q9WUP4 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Srd5a3Q9WUP4 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Srd5a3Q9WUP4 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Srd5a3Q9WUP4 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Srd5a3Q9WUP4 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Srd5a3Q9WUP4 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Srd5a3Q9WUP4 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Srd5a3Q9WUP4 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Srd5a3Q9WUP4 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Srd5a3Q9WUP4 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Srd5a3Q9WUP4 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Srd5a3Q9WUP4 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Srd5a3Q9WUP4 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Srd5a3Q9WUP4 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Srd5a3Q9WUP4 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Srd5a3Q9WUP4 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Srd5a3Q9WUP4 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Srd5a3Q9WUP4 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Srd5a3Q9WUP4 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Srd5a3Q9WUP4 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Srd5a3Q9WUP4 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Srd5a3Q9WUP4 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Srd5a3Q9WUP4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Srd5a3Q9WUP4 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Srd5a3Q9WUP4 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Srd5a3Q9WUP4 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Srd5a3Q9WUP4 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Srd5a3Q9WUP4 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Srd5a3Q9WUP4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Srd5a3Q9WUP4 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Srd5a3Q9WUP4 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Srd5a3Q9WUP4 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Srd5a3Q9WUP4 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Srd5a3Q9WUP4 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Srd5a3Q9WUP4 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Srd5a3Q9WUP4 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Srd5a3Q9WUP4 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Srd5a3Q9WUP4 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Srd5a3Q9WUP4 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Srd5a3Q9WUP4 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Srd5a3Q9WUP4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Srd5a3Q9WUP4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Srd5a3Q9WUP4 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Srd5a3Q9WUP4 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Srd5a3Q9WUP4 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Srd5a3Q9WUP4 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Srd5a3Q9WUP4 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Srd5a3Q9WUP4 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Srd5a3Q9WUP4 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Srd5a3Q9WUP4 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Srd5a3Q9WUP4 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Srd5a3Q9WUP4 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Srd5a3Q9WUP4 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Srd5a3Q9WUP4 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Srd5a3Q9WUP4 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Srd5a3Q9WUP4 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Srd5a3Q9WUP4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Srd5a3Q9WUP4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 136.3 ms