Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU78

Pdcd6ip, Programmed cell death 6-interacting protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd6ipQ9WU78 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Pdcd6ipQ9WU78 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Pdcd6ipQ9WU78 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Pdcd6ipQ9WU78 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Pdcd6ipQ9WU78 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Pdcd6ipQ9WU78 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Pdcd6ipQ9WU78 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Pdcd6ipQ9WU78 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Pdcd6ipQ9WU78 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Pdcd6ipQ9WU78 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Pdcd6ipQ9WU78 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Pdcd6ipQ9WU78 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Pdcd6ipQ9WU78 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Pdcd6ipQ9WU78 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Pdcd6ipQ9WU78 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Pdcd6ipQ9WU78 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Pdcd6ipQ9WU78 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Pdcd6ipQ9WU78 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Pdcd6ipQ9WU78 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Pdcd6ipQ9WU78 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Pdcd6ipQ9WU78 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Pdcd6ipQ9WU78 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Pdcd6ipQ9WU78 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Pdcd6ipQ9WU78 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Pdcd6ipQ9WU78 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Pdcd6ipQ9WU78 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Pdcd6ipQ9WU78 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Pdcd6ipQ9WU78 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Pdcd6ipQ9WU78 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Pdcd6ipQ9WU78 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Pdcd6ipQ9WU78 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Pdcd6ipQ9WU78 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Pdcd6ipQ9WU78 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Pdcd6ipQ9WU78 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Pdcd6ipQ9WU78 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Pdcd6ipQ9WU78 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Pdcd6ipQ9WU78 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Pdcd6ipQ9WU78 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Pdcd6ipQ9WU78 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Pdcd6ipQ9WU78 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Pdcd6ipQ9WU78 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Pdcd6ipQ9WU78 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Pdcd6ipQ9WU78 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Pdcd6ipQ9WU78 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Pdcd6ipQ9WU78 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Pdcd6ipQ9WU78 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Pdcd6ipQ9WU78 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Pdcd6ipQ9WU78 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Pdcd6ipQ9WU78 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Pdcd6ipQ9WU78 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Pdcd6ipQ9WU78 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Pdcd6ipQ9WU78 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Pdcd6ipQ9WU78 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Pdcd6ipQ9WU78 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Pdcd6ipQ9WU78 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Pdcd6ipQ9WU78 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Pdcd6ipQ9WU78 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Pdcd6ipQ9WU78 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Pdcd6ipQ9WU78 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Pdcd6ipQ9WU78 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Pdcd6ipQ9WU78 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Pdcd6ipQ9WU78 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Pdcd6ipQ9WU78 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Pdcd6ipQ9WU78 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Pdcd6ipQ9WU78 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Pdcd6ipQ9WU78 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Pdcd6ipQ9WU78 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Pdcd6ipQ9WU78 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Pdcd6ipQ9WU78 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Pdcd6ipQ9WU78 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Pdcd6ipQ9WU78 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Pdcd6ipQ9WU78 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Pdcd6ipQ9WU78 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Pdcd6ipQ9WU78 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Pdcd6ipQ9WU78 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC26.58■■□□□ 1.84
Pdcd6ipQ9WU78 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Pdcd6ipQ9WU78 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Pdcd6ipQ9WU78 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Pdcd6ipQ9WU78 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Pdcd6ipQ9WU78 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Pdcd6ipQ9WU78 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Pdcd6ipQ9WU78 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Pdcd6ipQ9WU78 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Pdcd6ipQ9WU78 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Pdcd6ipQ9WU78 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Pdcd6ipQ9WU78 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Pdcd6ipQ9WU78 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Pdcd6ipQ9WU78 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Pdcd6ipQ9WU78 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Pdcd6ipQ9WU78 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Pdcd6ipQ9WU78 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Pdcd6ipQ9WU78 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Pdcd6ipQ9WU78 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Pdcd6ipQ9WU78 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Pdcd6ipQ9WU78 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Pdcd6ipQ9WU78 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Pdcd6ipQ9WU78 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Pdcd6ipQ9WU78 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Pdcd6ipQ9WU78 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Pdcd6ipQ9WU78 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.8 ms