Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTX2

Prkra, Interferon-inducible double-stranded RNA-dependent protein kinase activator A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkraQ9WTX2 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PrkraQ9WTX2 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PrkraQ9WTX2 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PrkraQ9WTX2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PrkraQ9WTX2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PrkraQ9WTX2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PrkraQ9WTX2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PrkraQ9WTX2 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PrkraQ9WTX2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PrkraQ9WTX2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PrkraQ9WTX2 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PrkraQ9WTX2 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PrkraQ9WTX2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PrkraQ9WTX2 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PrkraQ9WTX2 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PrkraQ9WTX2 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PrkraQ9WTX2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PrkraQ9WTX2 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PrkraQ9WTX2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PrkraQ9WTX2 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PrkraQ9WTX2 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PrkraQ9WTX2 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PrkraQ9WTX2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PrkraQ9WTX2 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PrkraQ9WTX2 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PrkraQ9WTX2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PrkraQ9WTX2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PrkraQ9WTX2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PrkraQ9WTX2 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PrkraQ9WTX2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PrkraQ9WTX2 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PrkraQ9WTX2 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PrkraQ9WTX2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PrkraQ9WTX2 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PrkraQ9WTX2 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PrkraQ9WTX2 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PrkraQ9WTX2 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PrkraQ9WTX2 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PrkraQ9WTX2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PrkraQ9WTX2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PrkraQ9WTX2 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PrkraQ9WTX2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PrkraQ9WTX2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PrkraQ9WTX2 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PrkraQ9WTX2 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PrkraQ9WTX2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PrkraQ9WTX2 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PrkraQ9WTX2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PrkraQ9WTX2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PrkraQ9WTX2 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PrkraQ9WTX2 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PrkraQ9WTX2 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PrkraQ9WTX2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PrkraQ9WTX2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PrkraQ9WTX2 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PrkraQ9WTX2 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PrkraQ9WTX2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PrkraQ9WTX2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PrkraQ9WTX2 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PrkraQ9WTX2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PrkraQ9WTX2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PrkraQ9WTX2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PrkraQ9WTX2 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PrkraQ9WTX2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PrkraQ9WTX2 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PrkraQ9WTX2 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PrkraQ9WTX2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PrkraQ9WTX2 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PrkraQ9WTX2 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PrkraQ9WTX2 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PrkraQ9WTX2 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PrkraQ9WTX2 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PrkraQ9WTX2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PrkraQ9WTX2 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PrkraQ9WTX2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PrkraQ9WTX2 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PrkraQ9WTX2 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PrkraQ9WTX2 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PrkraQ9WTX2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PrkraQ9WTX2 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PrkraQ9WTX2 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PrkraQ9WTX2 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PrkraQ9WTX2 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PrkraQ9WTX2 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PrkraQ9WTX2 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PrkraQ9WTX2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PrkraQ9WTX2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PrkraQ9WTX2 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PrkraQ9WTX2 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PrkraQ9WTX2 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PrkraQ9WTX2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PrkraQ9WTX2 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PrkraQ9WTX2 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PrkraQ9WTX2 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PrkraQ9WTX2 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PrkraQ9WTX2 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PrkraQ9WTX2 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PrkraQ9WTX2 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PrkraQ9WTX2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PrkraQ9WTX2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms