Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTP9

Vax2, Ventral anterior homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vax2Q9WTP9 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vax2Q9WTP9 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vax2Q9WTP9 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vax2Q9WTP9 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vax2Q9WTP9 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vax2Q9WTP9 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vax2Q9WTP9 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vax2Q9WTP9 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vax2Q9WTP9 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vax2Q9WTP9 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vax2Q9WTP9 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vax2Q9WTP9 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vax2Q9WTP9 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vax2Q9WTP9 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vax2Q9WTP9 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vax2Q9WTP9 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vax2Q9WTP9 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vax2Q9WTP9 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vax2Q9WTP9 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vax2Q9WTP9 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vax2Q9WTP9 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vax2Q9WTP9 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vax2Q9WTP9 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vax2Q9WTP9 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vax2Q9WTP9 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vax2Q9WTP9 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vax2Q9WTP9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vax2Q9WTP9 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vax2Q9WTP9 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Vax2Q9WTP9 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vax2Q9WTP9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vax2Q9WTP9 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vax2Q9WTP9 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Vax2Q9WTP9 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vax2Q9WTP9 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vax2Q9WTP9 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vax2Q9WTP9 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vax2Q9WTP9 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vax2Q9WTP9 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vax2Q9WTP9 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vax2Q9WTP9 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vax2Q9WTP9 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vax2Q9WTP9 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vax2Q9WTP9 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Vax2Q9WTP9 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vax2Q9WTP9 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vax2Q9WTP9 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vax2Q9WTP9 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vax2Q9WTP9 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vax2Q9WTP9 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vax2Q9WTP9 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vax2Q9WTP9 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vax2Q9WTP9 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vax2Q9WTP9 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vax2Q9WTP9 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vax2Q9WTP9 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vax2Q9WTP9 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vax2Q9WTP9 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vax2Q9WTP9 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vax2Q9WTP9 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vax2Q9WTP9 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Vax2Q9WTP9 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vax2Q9WTP9 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Vax2Q9WTP9 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Vax2Q9WTP9 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vax2Q9WTP9 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vax2Q9WTP9 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vax2Q9WTP9 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vax2Q9WTP9 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vax2Q9WTP9 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vax2Q9WTP9 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vax2Q9WTP9 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vax2Q9WTP9 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vax2Q9WTP9 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Vax2Q9WTP9 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vax2Q9WTP9 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vax2Q9WTP9 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vax2Q9WTP9 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vax2Q9WTP9 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vax2Q9WTP9 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vax2Q9WTP9 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vax2Q9WTP9 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Vax2Q9WTP9 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Vax2Q9WTP9 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vax2Q9WTP9 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vax2Q9WTP9 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vax2Q9WTP9 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vax2Q9WTP9 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vax2Q9WTP9 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vax2Q9WTP9 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vax2Q9WTP9 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vax2Q9WTP9 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vax2Q9WTP9 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vax2Q9WTP9 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vax2Q9WTP9 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vax2Q9WTP9 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vax2Q9WTP9 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vax2Q9WTP9 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vax2Q9WTP9 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vax2Q9WTP9 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms