Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ERVW-1Q9UQF0 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ERVW-1Q9UQF0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ERVW-1Q9UQF0 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ERVW-1Q9UQF0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ERVW-1Q9UQF0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ERVW-1Q9UQF0 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ERVW-1Q9UQF0 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ERVW-1Q9UQF0 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ERVW-1Q9UQF0 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ERVW-1Q9UQF0 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ERVW-1Q9UQF0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
ERVW-1Q9UQF0 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ERVW-1Q9UQF0 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ERVW-1Q9UQF0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ERVW-1Q9UQF0 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ERVW-1Q9UQF0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ERVW-1Q9UQF0 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
ERVW-1Q9UQF0 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
ERVW-1Q9UQF0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ERVW-1Q9UQF0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ERVW-1Q9UQF0 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ERVW-1Q9UQF0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ERVW-1Q9UQF0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ERVW-1Q9UQF0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ERVW-1Q9UQF0 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ERVW-1Q9UQF0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ERVW-1Q9UQF0 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ERVW-1Q9UQF0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
ERVW-1Q9UQF0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
ERVW-1Q9UQF0 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ERVW-1Q9UQF0 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ERVW-1Q9UQF0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ERVW-1Q9UQF0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ERVW-1Q9UQF0 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ERVW-1Q9UQF0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ERVW-1Q9UQF0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ERVW-1Q9UQF0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ERVW-1Q9UQF0 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ERVW-1Q9UQF0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ERVW-1Q9UQF0 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ERVW-1Q9UQF0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ERVW-1Q9UQF0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ERVW-1Q9UQF0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ERVW-1Q9UQF0 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ERVW-1Q9UQF0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ERVW-1Q9UQF0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ERVW-1Q9UQF0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ERVW-1Q9UQF0 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ERVW-1Q9UQF0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ERVW-1Q9UQF0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ERVW-1Q9UQF0 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ERVW-1Q9UQF0 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ERVW-1Q9UQF0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ERVW-1Q9UQF0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ERVW-1Q9UQF0 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ERVW-1Q9UQF0 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ERVW-1Q9UQF0 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ERVW-1Q9UQF0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ERVW-1Q9UQF0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ERVW-1Q9UQF0 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ERVW-1Q9UQF0 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ERVW-1Q9UQF0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ERVW-1Q9UQF0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ERVW-1Q9UQF0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ERVW-1Q9UQF0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ERVW-1Q9UQF0 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ERVW-1Q9UQF0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ERVW-1Q9UQF0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
ERVW-1Q9UQF0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ERVW-1Q9UQF0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ERVW-1Q9UQF0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ERVW-1Q9UQF0 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ERVW-1Q9UQF0 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ERVW-1Q9UQF0 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ERVW-1Q9UQF0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ERVW-1Q9UQF0 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ERVW-1Q9UQF0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ERVW-1Q9UQF0 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ERVW-1Q9UQF0 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
ERVW-1Q9UQF0 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ERVW-1Q9UQF0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ERVW-1Q9UQF0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ERVW-1Q9UQF0 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ERVW-1Q9UQF0 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ERVW-1Q9UQF0 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ERVW-1Q9UQF0 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ERVW-1Q9UQF0 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
ERVW-1Q9UQF0 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ERVW-1Q9UQF0 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ERVW-1Q9UQF0 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ERVW-1Q9UQF0 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ERVW-1Q9UQF0 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ERVW-1Q9UQF0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
ERVW-1Q9UQF0 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ERVW-1Q9UQF0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ERVW-1Q9UQF0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ERVW-1Q9UQF0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ERVW-1Q9UQF0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ERVW-1Q9UQF0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms