Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ3

HPS5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS5Q9UPZ3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
HPS5Q9UPZ3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
HPS5Q9UPZ3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
HPS5Q9UPZ3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
HPS5Q9UPZ3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
HPS5Q9UPZ3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
HPS5Q9UPZ3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
HPS5Q9UPZ3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
HPS5Q9UPZ3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
HPS5Q9UPZ3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
HPS5Q9UPZ3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
HPS5Q9UPZ3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
HPS5Q9UPZ3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
HPS5Q9UPZ3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
HPS5Q9UPZ3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
HPS5Q9UPZ3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
HPS5Q9UPZ3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
HPS5Q9UPZ3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
HPS5Q9UPZ3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
HPS5Q9UPZ3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
HPS5Q9UPZ3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
HPS5Q9UPZ3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
HPS5Q9UPZ3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
HPS5Q9UPZ3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
HPS5Q9UPZ3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
HPS5Q9UPZ3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC30.15■■■□□ 2.42
HPS5Q9UPZ3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
HPS5Q9UPZ3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
HPS5Q9UPZ3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
HPS5Q9UPZ3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
HPS5Q9UPZ3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
HPS5Q9UPZ3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
HPS5Q9UPZ3 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
HPS5Q9UPZ3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
HPS5Q9UPZ3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
HPS5Q9UPZ3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
HPS5Q9UPZ3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
HPS5Q9UPZ3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30.1■■■□□ 2.41
HPS5Q9UPZ3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
HPS5Q9UPZ3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
HPS5Q9UPZ3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
HPS5Q9UPZ3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
HPS5Q9UPZ3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
HPS5Q9UPZ3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
HPS5Q9UPZ3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.41
HPS5Q9UPZ3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
HPS5Q9UPZ3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
HPS5Q9UPZ3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
HPS5Q9UPZ3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
HPS5Q9UPZ3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
HPS5Q9UPZ3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
HPS5Q9UPZ3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
HPS5Q9UPZ3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
HPS5Q9UPZ3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
HPS5Q9UPZ3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
HPS5Q9UPZ3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
HPS5Q9UPZ3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
HPS5Q9UPZ3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
HPS5Q9UPZ3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
HPS5Q9UPZ3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
HPS5Q9UPZ3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
HPS5Q9UPZ3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
HPS5Q9UPZ3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
HPS5Q9UPZ3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
HPS5Q9UPZ3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
HPS5Q9UPZ3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
HPS5Q9UPZ3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
HPS5Q9UPZ3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
HPS5Q9UPZ3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
HPS5Q9UPZ3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
HPS5Q9UPZ3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
HPS5Q9UPZ3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
HPS5Q9UPZ3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
HPS5Q9UPZ3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
HPS5Q9UPZ3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
HPS5Q9UPZ3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
HPS5Q9UPZ3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
HPS5Q9UPZ3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
HPS5Q9UPZ3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
HPS5Q9UPZ3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
HPS5Q9UPZ3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
HPS5Q9UPZ3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
HPS5Q9UPZ3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
HPS5Q9UPZ3 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
HPS5Q9UPZ3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
HPS5Q9UPZ3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
HPS5Q9UPZ3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
HPS5Q9UPZ3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
HPS5Q9UPZ3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
HPS5Q9UPZ3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
HPS5Q9UPZ3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
HPS5Q9UPZ3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
HPS5Q9UPZ3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
HPS5Q9UPZ3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
HPS5Q9UPZ3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
HPS5Q9UPZ3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
HPS5Q9UPZ3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
HPS5Q9UPZ3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
HPS5Q9UPZ3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
HPS5Q9UPZ3 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 210.4 ms