Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV0

CEP164, Centrosomal protein of 164 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP164Q9UPV0 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.1■■■■■ 4.65
CEP164Q9UPV0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.1■■■■■ 4.65
CEP164Q9UPV0 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC44.09■■■■■ 4.65
CEP164Q9UPV0 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.09■■■■■ 4.65
CEP164Q9UPV0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC44.09■■■■■ 4.65
CEP164Q9UPV0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC44.09■■■■■ 4.65
CEP164Q9UPV0 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC44.08■■■■■ 4.65
CEP164Q9UPV0 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC44.08■■■■■ 4.65
CEP164Q9UPV0 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.08■■■■■ 4.65
CEP164Q9UPV0 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC44.08■■■■■ 4.65
CEP164Q9UPV0 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC44.07■■■■■ 4.65
CEP164Q9UPV0 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.07■■■■■ 4.65
CEP164Q9UPV0 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC44.07■■■■■ 4.65
CEP164Q9UPV0 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC44.05■■■■■ 4.64
CEP164Q9UPV0 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.04■■■■■ 4.64
CEP164Q9UPV0 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.04■■■■■ 4.64
CEP164Q9UPV0 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC44.04■■■■■ 4.64
CEP164Q9UPV0 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC44.03■■■■■ 4.64
CEP164Q9UPV0 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC44.01■■■■■ 4.64
CEP164Q9UPV0 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44■■■■■ 4.63
CEP164Q9UPV0 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC44■■■■■ 4.63
CEP164Q9UPV0 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC44■■■■■ 4.63
CEP164Q9UPV0 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.99■■■■■ 4.63
CEP164Q9UPV0 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.98■■■■■ 4.63
CEP164Q9UPV0 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.97■■■■■ 4.63
CEP164Q9UPV0 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.97■■■■■ 4.63
CEP164Q9UPV0 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.96■■■■■ 4.63
CEP164Q9UPV0 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC43.96■■■■■ 4.63
CEP164Q9UPV0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.96■■■■■ 4.63
CEP164Q9UPV0 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC43.96■■■■■ 4.63
CEP164Q9UPV0 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.96■■■■■ 4.63
CEP164Q9UPV0 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC43.95■■■■■ 4.63
CEP164Q9UPV0 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC43.95■■■■■ 4.63
CEP164Q9UPV0 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.94■■■■■ 4.62
CEP164Q9UPV0 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC43.94■■■■■ 4.62
CEP164Q9UPV0 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.94■■■■■ 4.62
CEP164Q9UPV0 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.94■■■■■ 4.62
CEP164Q9UPV0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.93■■■■■ 4.62
CEP164Q9UPV0 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.93■■■■■ 4.62
CEP164Q9UPV0 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC43.93■■■■■ 4.62
CEP164Q9UPV0 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.92■■■■■ 4.62
CEP164Q9UPV0 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.92■■■■■ 4.62
CEP164Q9UPV0 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.92■■■■■ 4.62
CEP164Q9UPV0 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC43.91■■■■■ 4.62
CEP164Q9UPV0 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC43.91■■■■■ 4.62
CEP164Q9UPV0 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC43.91■■■■■ 4.62
CEP164Q9UPV0 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC43.91■■■■■ 4.62
CEP164Q9UPV0 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC43.91■■■■■ 4.62
CEP164Q9UPV0 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC43.91■■■■■ 4.62
CEP164Q9UPV0 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.9■■■■■ 4.62
CEP164Q9UPV0 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC43.9■■■■■ 4.62
CEP164Q9UPV0 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC43.9■■■■■ 4.62
CEP164Q9UPV0 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC43.89■■■■■ 4.62
CEP164Q9UPV0 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC43.89■■■■■ 4.62
CEP164Q9UPV0 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.88■■■■■ 4.62
CEP164Q9UPV0 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.88■■■■■ 4.61
CEP164Q9UPV0 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC43.86■■■■■ 4.61
CEP164Q9UPV0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.86■■■■■ 4.61
CEP164Q9UPV0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.85■■■■■ 4.61
CEP164Q9UPV0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.85■■■■■ 4.61
CEP164Q9UPV0 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.85■■■■■ 4.61
CEP164Q9UPV0 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.85■■■■■ 4.61
CEP164Q9UPV0 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC43.85■■■■■ 4.61
CEP164Q9UPV0 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC43.85■■■■■ 4.61
CEP164Q9UPV0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC43.85■■■■■ 4.61
CEP164Q9UPV0 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC43.83■■■■■ 4.61
CEP164Q9UPV0 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.83■■■■■ 4.61
CEP164Q9UPV0 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC43.81■■■■■ 4.6
CEP164Q9UPV0 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.81■■■■■ 4.6
CEP164Q9UPV0 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC43.81■■■■■ 4.6
CEP164Q9UPV0 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC43.8■■■■■ 4.6
CEP164Q9UPV0 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC43.8■■■■■ 4.6
CEP164Q9UPV0 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC43.79■■■■■ 4.6
CEP164Q9UPV0 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC43.79■■■■■ 4.6
CEP164Q9UPV0 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC43.78■■■■■ 4.6
CEP164Q9UPV0 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC43.78■■■■■ 4.6
CEP164Q9UPV0 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.78■■■■■ 4.6
CEP164Q9UPV0 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC43.77■■■■■ 4.6
CEP164Q9UPV0 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC43.77■■■■■ 4.6
CEP164Q9UPV0 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC43.77■■■■■ 4.6
CEP164Q9UPV0 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.77■■■■■ 4.6
CEP164Q9UPV0 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC43.77■■■■■ 4.6
CEP164Q9UPV0 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.77■■■■■ 4.6
CEP164Q9UPV0 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.76■■■■■ 4.6
CEP164Q9UPV0 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.76■■■■■ 4.6
CEP164Q9UPV0 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC43.76■■■■■ 4.6
CEP164Q9UPV0 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC43.76■■■■■ 4.6
CEP164Q9UPV0 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC43.76■■■■■ 4.6
CEP164Q9UPV0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC43.76■■■■■ 4.6
CEP164Q9UPV0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.75■■■■■ 4.59
CEP164Q9UPV0 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC43.75■■■■■ 4.59
CEP164Q9UPV0 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC43.75■■■■■ 4.59
CEP164Q9UPV0 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC43.75■■■■■ 4.59
CEP164Q9UPV0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.74■■■■■ 4.59
CEP164Q9UPV0 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC43.74■■■■■ 4.59
CEP164Q9UPV0 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC43.74■■■■■ 4.59
CEP164Q9UPV0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.74■■■■■ 4.59
CEP164Q9UPV0 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC43.73■■■■■ 4.59
CEP164Q9UPV0 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC43.73■■■■■ 4.59
CEP164Q9UPV0 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.72■■■■■ 4.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms