Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPU9

SAMD4A, Protein Smaug homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD4AQ9UPU9 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SAMD4AQ9UPU9 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SAMD4AQ9UPU9 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SAMD4AQ9UPU9 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SAMD4AQ9UPU9 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SAMD4AQ9UPU9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SAMD4AQ9UPU9 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SAMD4AQ9UPU9 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SAMD4AQ9UPU9 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SAMD4AQ9UPU9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SAMD4AQ9UPU9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SAMD4AQ9UPU9 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SAMD4AQ9UPU9 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SAMD4AQ9UPU9 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SAMD4AQ9UPU9 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SAMD4AQ9UPU9 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SAMD4AQ9UPU9 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SAMD4AQ9UPU9 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SAMD4AQ9UPU9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SAMD4AQ9UPU9 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SAMD4AQ9UPU9 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SAMD4AQ9UPU9 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SAMD4AQ9UPU9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SAMD4AQ9UPU9 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SAMD4AQ9UPU9 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SAMD4AQ9UPU9 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SAMD4AQ9UPU9 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SAMD4AQ9UPU9 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SAMD4AQ9UPU9 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SAMD4AQ9UPU9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SAMD4AQ9UPU9 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SAMD4AQ9UPU9 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SAMD4AQ9UPU9 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SAMD4AQ9UPU9 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SAMD4AQ9UPU9 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SAMD4AQ9UPU9 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SAMD4AQ9UPU9 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SAMD4AQ9UPU9 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SAMD4AQ9UPU9 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SAMD4AQ9UPU9 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SAMD4AQ9UPU9 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SAMD4AQ9UPU9 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SAMD4AQ9UPU9 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SAMD4AQ9UPU9 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SAMD4AQ9UPU9 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SAMD4AQ9UPU9 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SAMD4AQ9UPU9 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SAMD4AQ9UPU9 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SAMD4AQ9UPU9 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SAMD4AQ9UPU9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SAMD4AQ9UPU9 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SAMD4AQ9UPU9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SAMD4AQ9UPU9 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SAMD4AQ9UPU9 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SAMD4AQ9UPU9 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SAMD4AQ9UPU9 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SAMD4AQ9UPU9 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SAMD4AQ9UPU9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SAMD4AQ9UPU9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SAMD4AQ9UPU9 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SAMD4AQ9UPU9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SAMD4AQ9UPU9 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SAMD4AQ9UPU9 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SAMD4AQ9UPU9 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SAMD4AQ9UPU9 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SAMD4AQ9UPU9 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SAMD4AQ9UPU9 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SAMD4AQ9UPU9 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SAMD4AQ9UPU9 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SAMD4AQ9UPU9 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SAMD4AQ9UPU9 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SAMD4AQ9UPU9 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SAMD4AQ9UPU9 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SAMD4AQ9UPU9 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SAMD4AQ9UPU9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SAMD4AQ9UPU9 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SAMD4AQ9UPU9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SAMD4AQ9UPU9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SAMD4AQ9UPU9 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SAMD4AQ9UPU9 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SAMD4AQ9UPU9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SAMD4AQ9UPU9 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SAMD4AQ9UPU9 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SAMD4AQ9UPU9 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SAMD4AQ9UPU9 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SAMD4AQ9UPU9 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SAMD4AQ9UPU9 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SAMD4AQ9UPU9 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SAMD4AQ9UPU9 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SAMD4AQ9UPU9 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SAMD4AQ9UPU9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SAMD4AQ9UPU9 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SAMD4AQ9UPU9 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SAMD4AQ9UPU9 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SAMD4AQ9UPU9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SAMD4AQ9UPU9 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SAMD4AQ9UPU9 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SAMD4AQ9UPU9 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SAMD4AQ9UPU9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SAMD4AQ9UPU9 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms