Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULM2

ZNF490, Zinc finger protein 490, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF490Q9ULM2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF490Q9ULM2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF490Q9ULM2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZNF490Q9ULM2 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNF490Q9ULM2 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNF490Q9ULM2 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNF490Q9ULM2 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF490Q9ULM2 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF490Q9ULM2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF490Q9ULM2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF490Q9ULM2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF490Q9ULM2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF490Q9ULM2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF490Q9ULM2 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF490Q9ULM2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF490Q9ULM2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF490Q9ULM2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF490Q9ULM2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF490Q9ULM2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF490Q9ULM2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF490Q9ULM2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF490Q9ULM2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF490Q9ULM2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF490Q9ULM2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF490Q9ULM2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF490Q9ULM2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF490Q9ULM2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF490Q9ULM2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF490Q9ULM2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF490Q9ULM2 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF490Q9ULM2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF490Q9ULM2 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF490Q9ULM2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF490Q9ULM2 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF490Q9ULM2 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF490Q9ULM2 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
ZNF490Q9ULM2 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF490Q9ULM2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF490Q9ULM2 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF490Q9ULM2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF490Q9ULM2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF490Q9ULM2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF490Q9ULM2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF490Q9ULM2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF490Q9ULM2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF490Q9ULM2 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF490Q9ULM2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF490Q9ULM2 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF490Q9ULM2 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF490Q9ULM2 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF490Q9ULM2 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF490Q9ULM2 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF490Q9ULM2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF490Q9ULM2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF490Q9ULM2 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF490Q9ULM2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF490Q9ULM2 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF490Q9ULM2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF490Q9ULM2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF490Q9ULM2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF490Q9ULM2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF490Q9ULM2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF490Q9ULM2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF490Q9ULM2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF490Q9ULM2 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF490Q9ULM2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF490Q9ULM2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF490Q9ULM2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF490Q9ULM2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF490Q9ULM2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF490Q9ULM2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF490Q9ULM2 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF490Q9ULM2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF490Q9ULM2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF490Q9ULM2 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF490Q9ULM2 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF490Q9ULM2 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF490Q9ULM2 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF490Q9ULM2 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF490Q9ULM2 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF490Q9ULM2 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF490Q9ULM2 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF490Q9ULM2 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF490Q9ULM2 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF490Q9ULM2 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF490Q9ULM2 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF490Q9ULM2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF490Q9ULM2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF490Q9ULM2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF490Q9ULM2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF490Q9ULM2 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF490Q9ULM2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF490Q9ULM2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF490Q9ULM2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF490Q9ULM2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF490Q9ULM2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF490Q9ULM2 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF490Q9ULM2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF490Q9ULM2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF490Q9ULM2 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms