Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL40

ZNF346, Zinc finger protein 346, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF346Q9UL40 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF346Q9UL40 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF346Q9UL40 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF346Q9UL40 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF346Q9UL40 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF346Q9UL40 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF346Q9UL40 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF346Q9UL40 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF346Q9UL40 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF346Q9UL40 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF346Q9UL40 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF346Q9UL40 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF346Q9UL40 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF346Q9UL40 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF346Q9UL40 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF346Q9UL40 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF346Q9UL40 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF346Q9UL40 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF346Q9UL40 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF346Q9UL40 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF346Q9UL40 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF346Q9UL40 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF346Q9UL40 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF346Q9UL40 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF346Q9UL40 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF346Q9UL40 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF346Q9UL40 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF346Q9UL40 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF346Q9UL40 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF346Q9UL40 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF346Q9UL40 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF346Q9UL40 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF346Q9UL40 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF346Q9UL40 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF346Q9UL40 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF346Q9UL40 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF346Q9UL40 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF346Q9UL40 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF346Q9UL40 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF346Q9UL40 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF346Q9UL40 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF346Q9UL40 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF346Q9UL40 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF346Q9UL40 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF346Q9UL40 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF346Q9UL40 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF346Q9UL40 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF346Q9UL40 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF346Q9UL40 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF346Q9UL40 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF346Q9UL40 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF346Q9UL40 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF346Q9UL40 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF346Q9UL40 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF346Q9UL40 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF346Q9UL40 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF346Q9UL40 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF346Q9UL40 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF346Q9UL40 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF346Q9UL40 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF346Q9UL40 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF346Q9UL40 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF346Q9UL40 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF346Q9UL40 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF346Q9UL40 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF346Q9UL40 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF346Q9UL40 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF346Q9UL40 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF346Q9UL40 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF346Q9UL40 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF346Q9UL40 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF346Q9UL40 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF346Q9UL40 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF346Q9UL40 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF346Q9UL40 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF346Q9UL40 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF346Q9UL40 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF346Q9UL40 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF346Q9UL40 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF346Q9UL40 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF346Q9UL40 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF346Q9UL40 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF346Q9UL40 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF346Q9UL40 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF346Q9UL40 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF346Q9UL40 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF346Q9UL40 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF346Q9UL40 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF346Q9UL40 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF346Q9UL40 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF346Q9UL40 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF346Q9UL40 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF346Q9UL40 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF346Q9UL40 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF346Q9UL40 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF346Q9UL40 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZNF346Q9UL40 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF346Q9UL40 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF346Q9UL40 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF346Q9UL40 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 135.8 ms