Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAPPC2LQ9UL33 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAPPC2LQ9UL33 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAPPC2LQ9UL33 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAPPC2LQ9UL33 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRAPPC2LQ9UL33 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRAPPC2LQ9UL33 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRAPPC2LQ9UL33 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRAPPC2LQ9UL33 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRAPPC2LQ9UL33 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRAPPC2LQ9UL33 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRAPPC2LQ9UL33 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRAPPC2LQ9UL33 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
TRAPPC2LQ9UL33 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRAPPC2LQ9UL33 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRAPPC2LQ9UL33 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRAPPC2LQ9UL33 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRAPPC2LQ9UL33 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRAPPC2LQ9UL33 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRAPPC2LQ9UL33 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TRAPPC2LQ9UL33 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TRAPPC2LQ9UL33 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRAPPC2LQ9UL33 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRAPPC2LQ9UL33 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRAPPC2LQ9UL33 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRAPPC2LQ9UL33 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRAPPC2LQ9UL33 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRAPPC2LQ9UL33 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRAPPC2LQ9UL33 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRAPPC2LQ9UL33 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRAPPC2LQ9UL33 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRAPPC2LQ9UL33 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRAPPC2LQ9UL33 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRAPPC2LQ9UL33 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRAPPC2LQ9UL33 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRAPPC2LQ9UL33 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRAPPC2LQ9UL33 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRAPPC2LQ9UL33 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRAPPC2LQ9UL33 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRAPPC2LQ9UL33 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRAPPC2LQ9UL33 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRAPPC2LQ9UL33 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRAPPC2LQ9UL33 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRAPPC2LQ9UL33 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
TRAPPC2LQ9UL33 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRAPPC2LQ9UL33 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRAPPC2LQ9UL33 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRAPPC2LQ9UL33 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRAPPC2LQ9UL33 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRAPPC2LQ9UL33 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRAPPC2LQ9UL33 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRAPPC2LQ9UL33 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRAPPC2LQ9UL33 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRAPPC2LQ9UL33 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRAPPC2LQ9UL33 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRAPPC2LQ9UL33 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRAPPC2LQ9UL33 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
TRAPPC2LQ9UL33 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRAPPC2LQ9UL33 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRAPPC2LQ9UL33 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRAPPC2LQ9UL33 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRAPPC2LQ9UL33 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRAPPC2LQ9UL33 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRAPPC2LQ9UL33 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRAPPC2LQ9UL33 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRAPPC2LQ9UL33 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRAPPC2LQ9UL33 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
TRAPPC2LQ9UL33 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRAPPC2LQ9UL33 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRAPPC2LQ9UL33 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRAPPC2LQ9UL33 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRAPPC2LQ9UL33 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRAPPC2LQ9UL33 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRAPPC2LQ9UL33 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRAPPC2LQ9UL33 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRAPPC2LQ9UL33 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRAPPC2LQ9UL33 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRAPPC2LQ9UL33 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRAPPC2LQ9UL33 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRAPPC2LQ9UL33 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRAPPC2LQ9UL33 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRAPPC2LQ9UL33 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRAPPC2LQ9UL33 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRAPPC2LQ9UL33 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRAPPC2LQ9UL33 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRAPPC2LQ9UL33 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRAPPC2LQ9UL33 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRAPPC2LQ9UL33 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRAPPC2LQ9UL33 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRAPPC2LQ9UL33 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRAPPC2LQ9UL33 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRAPPC2LQ9UL33 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRAPPC2LQ9UL33 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRAPPC2LQ9UL33 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRAPPC2LQ9UL33 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRAPPC2LQ9UL33 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRAPPC2LQ9UL33 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRAPPC2LQ9UL33 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRAPPC2LQ9UL33 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms