Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL12

SARDH, Sarcosine dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SARDHQ9UL12 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SARDHQ9UL12 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SARDHQ9UL12 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SARDHQ9UL12 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SARDHQ9UL12 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SARDHQ9UL12 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SARDHQ9UL12 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SARDHQ9UL12 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SARDHQ9UL12 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
SARDHQ9UL12 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SARDHQ9UL12 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SARDHQ9UL12 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SARDHQ9UL12 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SARDHQ9UL12 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SARDHQ9UL12 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SARDHQ9UL12 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SARDHQ9UL12 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SARDHQ9UL12 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SARDHQ9UL12 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SARDHQ9UL12 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SARDHQ9UL12 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SARDHQ9UL12 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SARDHQ9UL12 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SARDHQ9UL12 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SARDHQ9UL12 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SARDHQ9UL12 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
SARDHQ9UL12 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SARDHQ9UL12 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SARDHQ9UL12 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SARDHQ9UL12 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SARDHQ9UL12 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SARDHQ9UL12 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SARDHQ9UL12 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SARDHQ9UL12 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SARDHQ9UL12 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SARDHQ9UL12 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SARDHQ9UL12 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SARDHQ9UL12 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SARDHQ9UL12 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SARDHQ9UL12 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SARDHQ9UL12 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SARDHQ9UL12 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SARDHQ9UL12 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SARDHQ9UL12 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SARDHQ9UL12 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SARDHQ9UL12 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SARDHQ9UL12 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SARDHQ9UL12 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SARDHQ9UL12 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SARDHQ9UL12 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SARDHQ9UL12 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SARDHQ9UL12 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SARDHQ9UL12 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SARDHQ9UL12 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SARDHQ9UL12 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SARDHQ9UL12 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SARDHQ9UL12 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SARDHQ9UL12 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SARDHQ9UL12 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SARDHQ9UL12 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SARDHQ9UL12 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SARDHQ9UL12 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SARDHQ9UL12 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SARDHQ9UL12 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SARDHQ9UL12 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SARDHQ9UL12 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SARDHQ9UL12 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SARDHQ9UL12 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SARDHQ9UL12 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SARDHQ9UL12 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SARDHQ9UL12 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SARDHQ9UL12 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SARDHQ9UL12 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SARDHQ9UL12 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SARDHQ9UL12 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SARDHQ9UL12 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SARDHQ9UL12 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SARDHQ9UL12 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SARDHQ9UL12 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SARDHQ9UL12 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SARDHQ9UL12 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SARDHQ9UL12 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SARDHQ9UL12 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SARDHQ9UL12 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SARDHQ9UL12 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SARDHQ9UL12 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SARDHQ9UL12 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SARDHQ9UL12 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SARDHQ9UL12 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SARDHQ9UL12 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SARDHQ9UL12 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SARDHQ9UL12 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SARDHQ9UL12 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SARDHQ9UL12 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SARDHQ9UL12 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SARDHQ9UL12 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SARDHQ9UL12 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SARDHQ9UL12 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SARDHQ9UL12 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SARDHQ9UL12 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms