Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKY7

CDV3, Protein CDV3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDV3Q9UKY7 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CDV3Q9UKY7 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDV3Q9UKY7 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDV3Q9UKY7 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDV3Q9UKY7 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDV3Q9UKY7 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDV3Q9UKY7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CDV3Q9UKY7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDV3Q9UKY7 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDV3Q9UKY7 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDV3Q9UKY7 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDV3Q9UKY7 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDV3Q9UKY7 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDV3Q9UKY7 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDV3Q9UKY7 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDV3Q9UKY7 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDV3Q9UKY7 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDV3Q9UKY7 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDV3Q9UKY7 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDV3Q9UKY7 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDV3Q9UKY7 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDV3Q9UKY7 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CDV3Q9UKY7 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDV3Q9UKY7 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDV3Q9UKY7 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDV3Q9UKY7 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDV3Q9UKY7 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDV3Q9UKY7 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDV3Q9UKY7 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDV3Q9UKY7 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDV3Q9UKY7 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDV3Q9UKY7 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDV3Q9UKY7 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDV3Q9UKY7 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CDV3Q9UKY7 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDV3Q9UKY7 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CDV3Q9UKY7 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDV3Q9UKY7 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDV3Q9UKY7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDV3Q9UKY7 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CDV3Q9UKY7 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CDV3Q9UKY7 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDV3Q9UKY7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDV3Q9UKY7 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDV3Q9UKY7 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDV3Q9UKY7 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDV3Q9UKY7 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CDV3Q9UKY7 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDV3Q9UKY7 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDV3Q9UKY7 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CDV3Q9UKY7 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDV3Q9UKY7 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDV3Q9UKY7 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDV3Q9UKY7 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDV3Q9UKY7 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDV3Q9UKY7 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDV3Q9UKY7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDV3Q9UKY7 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDV3Q9UKY7 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CDV3Q9UKY7 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDV3Q9UKY7 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDV3Q9UKY7 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDV3Q9UKY7 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CDV3Q9UKY7 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDV3Q9UKY7 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDV3Q9UKY7 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDV3Q9UKY7 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDV3Q9UKY7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDV3Q9UKY7 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDV3Q9UKY7 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDV3Q9UKY7 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDV3Q9UKY7 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDV3Q9UKY7 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDV3Q9UKY7 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDV3Q9UKY7 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDV3Q9UKY7 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDV3Q9UKY7 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDV3Q9UKY7 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDV3Q9UKY7 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDV3Q9UKY7 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDV3Q9UKY7 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDV3Q9UKY7 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDV3Q9UKY7 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDV3Q9UKY7 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDV3Q9UKY7 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDV3Q9UKY7 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDV3Q9UKY7 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDV3Q9UKY7 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CDV3Q9UKY7 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDV3Q9UKY7 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDV3Q9UKY7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDV3Q9UKY7 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDV3Q9UKY7 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CDV3Q9UKY7 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDV3Q9UKY7 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDV3Q9UKY7 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDV3Q9UKY7 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDV3Q9UKY7 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CDV3Q9UKY7 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDV3Q9UKY7 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms