Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKR5

ERG28, Probable ergosterol biosynthetic protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERG28Q9UKR5 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERG28Q9UKR5 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERG28Q9UKR5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERG28Q9UKR5 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERG28Q9UKR5 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERG28Q9UKR5 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERG28Q9UKR5 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERG28Q9UKR5 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERG28Q9UKR5 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERG28Q9UKR5 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERG28Q9UKR5 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERG28Q9UKR5 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERG28Q9UKR5 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERG28Q9UKR5 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERG28Q9UKR5 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERG28Q9UKR5 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERG28Q9UKR5 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERG28Q9UKR5 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ERG28Q9UKR5 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERG28Q9UKR5 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERG28Q9UKR5 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERG28Q9UKR5 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERG28Q9UKR5 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERG28Q9UKR5 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERG28Q9UKR5 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERG28Q9UKR5 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERG28Q9UKR5 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERG28Q9UKR5 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERG28Q9UKR5 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERG28Q9UKR5 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERG28Q9UKR5 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERG28Q9UKR5 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ERG28Q9UKR5 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERG28Q9UKR5 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERG28Q9UKR5 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERG28Q9UKR5 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERG28Q9UKR5 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERG28Q9UKR5 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
ERG28Q9UKR5 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERG28Q9UKR5 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERG28Q9UKR5 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERG28Q9UKR5 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERG28Q9UKR5 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERG28Q9UKR5 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERG28Q9UKR5 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERG28Q9UKR5 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERG28Q9UKR5 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERG28Q9UKR5 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERG28Q9UKR5 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERG28Q9UKR5 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERG28Q9UKR5 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERG28Q9UKR5 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERG28Q9UKR5 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERG28Q9UKR5 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERG28Q9UKR5 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ERG28Q9UKR5 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERG28Q9UKR5 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERG28Q9UKR5 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERG28Q9UKR5 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERG28Q9UKR5 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERG28Q9UKR5 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERG28Q9UKR5 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERG28Q9UKR5 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERG28Q9UKR5 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERG28Q9UKR5 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERG28Q9UKR5 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERG28Q9UKR5 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERG28Q9UKR5 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERG28Q9UKR5 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERG28Q9UKR5 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERG28Q9UKR5 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERG28Q9UKR5 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERG28Q9UKR5 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERG28Q9UKR5 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERG28Q9UKR5 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERG28Q9UKR5 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERG28Q9UKR5 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERG28Q9UKR5 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERG28Q9UKR5 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ERG28Q9UKR5 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ERG28Q9UKR5 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
ERG28Q9UKR5 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ERG28Q9UKR5 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERG28Q9UKR5 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERG28Q9UKR5 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERG28Q9UKR5 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERG28Q9UKR5 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERG28Q9UKR5 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERG28Q9UKR5 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERG28Q9UKR5 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERG28Q9UKR5 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERG28Q9UKR5 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERG28Q9UKR5 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERG28Q9UKR5 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERG28Q9UKR5 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERG28Q9UKR5 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERG28Q9UKR5 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERG28Q9UKR5 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERG28Q9UKR5 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERG28Q9UKR5 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms