Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKN5

PRDM4, PR domain zinc finger protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM4Q9UKN5 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRDM4Q9UKN5 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
PRDM4Q9UKN5 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRDM4Q9UKN5 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRDM4Q9UKN5 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRDM4Q9UKN5 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRDM4Q9UKN5 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRDM4Q9UKN5 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRDM4Q9UKN5 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRDM4Q9UKN5 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRDM4Q9UKN5 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRDM4Q9UKN5 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRDM4Q9UKN5 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRDM4Q9UKN5 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRDM4Q9UKN5 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRDM4Q9UKN5 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRDM4Q9UKN5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRDM4Q9UKN5 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRDM4Q9UKN5 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRDM4Q9UKN5 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRDM4Q9UKN5 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRDM4Q9UKN5 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRDM4Q9UKN5 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRDM4Q9UKN5 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRDM4Q9UKN5 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRDM4Q9UKN5 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRDM4Q9UKN5 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRDM4Q9UKN5 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRDM4Q9UKN5 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRDM4Q9UKN5 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRDM4Q9UKN5 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRDM4Q9UKN5 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRDM4Q9UKN5 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRDM4Q9UKN5 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRDM4Q9UKN5 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRDM4Q9UKN5 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRDM4Q9UKN5 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRDM4Q9UKN5 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRDM4Q9UKN5 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRDM4Q9UKN5 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
PRDM4Q9UKN5 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PRDM4Q9UKN5 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PRDM4Q9UKN5 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PRDM4Q9UKN5 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRDM4Q9UKN5 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRDM4Q9UKN5 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRDM4Q9UKN5 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRDM4Q9UKN5 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRDM4Q9UKN5 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRDM4Q9UKN5 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRDM4Q9UKN5 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRDM4Q9UKN5 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRDM4Q9UKN5 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
PRDM4Q9UKN5 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRDM4Q9UKN5 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRDM4Q9UKN5 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
PRDM4Q9UKN5 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRDM4Q9UKN5 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRDM4Q9UKN5 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
PRDM4Q9UKN5 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
PRDM4Q9UKN5 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRDM4Q9UKN5 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRDM4Q9UKN5 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRDM4Q9UKN5 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
PRDM4Q9UKN5 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
PRDM4Q9UKN5 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRDM4Q9UKN5 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
PRDM4Q9UKN5 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRDM4Q9UKN5 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRDM4Q9UKN5 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRDM4Q9UKN5 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRDM4Q9UKN5 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRDM4Q9UKN5 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRDM4Q9UKN5 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRDM4Q9UKN5 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRDM4Q9UKN5 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRDM4Q9UKN5 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRDM4Q9UKN5 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRDM4Q9UKN5 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRDM4Q9UKN5 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRDM4Q9UKN5 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRDM4Q9UKN5 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRDM4Q9UKN5 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRDM4Q9UKN5 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRDM4Q9UKN5 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRDM4Q9UKN5 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRDM4Q9UKN5 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRDM4Q9UKN5 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRDM4Q9UKN5 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRDM4Q9UKN5 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
PRDM4Q9UKN5 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PRDM4Q9UKN5 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PRDM4Q9UKN5 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRDM4Q9UKN5 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRDM4Q9UKN5 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRDM4Q9UKN5 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRDM4Q9UKN5 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRDM4Q9UKN5 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRDM4Q9UKN5 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRDM4Q9UKN5 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms