Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL3

CASP8AP2, CASP8-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,982 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP8AP2Q9UKL3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CASP8AP2Q9UKL3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CASP8AP2Q9UKL3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CASP8AP2Q9UKL3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CASP8AP2Q9UKL3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CASP8AP2Q9UKL3 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CASP8AP2Q9UKL3 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CASP8AP2Q9UKL3 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CASP8AP2Q9UKL3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CASP8AP2Q9UKL3 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
CASP8AP2Q9UKL3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CASP8AP2Q9UKL3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CASP8AP2Q9UKL3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CASP8AP2Q9UKL3 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CASP8AP2Q9UKL3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CASP8AP2Q9UKL3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CASP8AP2Q9UKL3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CASP8AP2Q9UKL3 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CASP8AP2Q9UKL3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CASP8AP2Q9UKL3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CASP8AP2Q9UKL3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
CASP8AP2Q9UKL3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CASP8AP2Q9UKL3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CASP8AP2Q9UKL3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CASP8AP2Q9UKL3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CASP8AP2Q9UKL3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CASP8AP2Q9UKL3 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CASP8AP2Q9UKL3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CASP8AP2Q9UKL3 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CASP8AP2Q9UKL3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CASP8AP2Q9UKL3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CASP8AP2Q9UKL3 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CASP8AP2Q9UKL3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
CASP8AP2Q9UKL3 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CASP8AP2Q9UKL3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
CASP8AP2Q9UKL3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
CASP8AP2Q9UKL3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
CASP8AP2Q9UKL3 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CASP8AP2Q9UKL3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
CASP8AP2Q9UKL3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CASP8AP2Q9UKL3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CASP8AP2Q9UKL3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
CASP8AP2Q9UKL3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CASP8AP2Q9UKL3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CASP8AP2Q9UKL3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CASP8AP2Q9UKL3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CASP8AP2Q9UKL3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CASP8AP2Q9UKL3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CASP8AP2Q9UKL3 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CASP8AP2Q9UKL3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CASP8AP2Q9UKL3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
CASP8AP2Q9UKL3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CASP8AP2Q9UKL3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CASP8AP2Q9UKL3 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.29
CASP8AP2Q9UKL3 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.29
CASP8AP2Q9UKL3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CASP8AP2Q9UKL3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CASP8AP2Q9UKL3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CASP8AP2Q9UKL3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CASP8AP2Q9UKL3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
CASP8AP2Q9UKL3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CASP8AP2Q9UKL3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CASP8AP2Q9UKL3 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
CASP8AP2Q9UKL3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
CASP8AP2Q9UKL3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
CASP8AP2Q9UKL3 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
CASP8AP2Q9UKL3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CASP8AP2Q9UKL3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CASP8AP2Q9UKL3 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CASP8AP2Q9UKL3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
CASP8AP2Q9UKL3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CASP8AP2Q9UKL3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
CASP8AP2Q9UKL3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CASP8AP2Q9UKL3 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CASP8AP2Q9UKL3 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CASP8AP2Q9UKL3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CASP8AP2Q9UKL3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CASP8AP2Q9UKL3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CASP8AP2Q9UKL3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CASP8AP2Q9UKL3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CASP8AP2Q9UKL3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
CASP8AP2Q9UKL3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CASP8AP2Q9UKL3 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
CASP8AP2Q9UKL3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CASP8AP2Q9UKL3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CASP8AP2Q9UKL3 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CASP8AP2Q9UKL3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CASP8AP2Q9UKL3 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CASP8AP2Q9UKL3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CASP8AP2Q9UKL3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CASP8AP2Q9UKL3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CASP8AP2Q9UKL3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CASP8AP2Q9UKL3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CASP8AP2Q9UKL3 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CASP8AP2Q9UKL3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CASP8AP2Q9UKL3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CASP8AP2Q9UKL3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CASP8AP2Q9UKL3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CASP8AP2Q9UKL3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CASP8AP2Q9UKL3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.4 ms