Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKK3

PARP4, Poly [ADP-ribose] polymerase 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP4Q9UKK3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
PARP4Q9UKK3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
PARP4Q9UKK3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.76■■■■□ 3
PARP4Q9UKK3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
PARP4Q9UKK3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
PARP4Q9UKK3 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
PARP4Q9UKK3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
PARP4Q9UKK3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
PARP4Q9UKK3 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC33.74■■■□□ 2.99
PARP4Q9UKK3 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
PARP4Q9UKK3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
PARP4Q9UKK3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
PARP4Q9UKK3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
PARP4Q9UKK3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
PARP4Q9UKK3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
PARP4Q9UKK3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
PARP4Q9UKK3 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
PARP4Q9UKK3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
PARP4Q9UKK3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
PARP4Q9UKK3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
PARP4Q9UKK3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
PARP4Q9UKK3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
PARP4Q9UKK3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
PARP4Q9UKK3 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
PARP4Q9UKK3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
PARP4Q9UKK3 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
PARP4Q9UKK3 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
PARP4Q9UKK3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
PARP4Q9UKK3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
PARP4Q9UKK3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.68■■■□□ 2.98
PARP4Q9UKK3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
PARP4Q9UKK3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
PARP4Q9UKK3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
PARP4Q9UKK3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC33.67■■■□□ 2.98
PARP4Q9UKK3 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC33.67■■■□□ 2.98
PARP4Q9UKK3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
PARP4Q9UKK3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
PARP4Q9UKK3 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
PARP4Q9UKK3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
PARP4Q9UKK3 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
PARP4Q9UKK3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
PARP4Q9UKK3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
PARP4Q9UKK3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
PARP4Q9UKK3 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
PARP4Q9UKK3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
PARP4Q9UKK3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
PARP4Q9UKK3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
PARP4Q9UKK3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
PARP4Q9UKK3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
PARP4Q9UKK3 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
PARP4Q9UKK3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
PARP4Q9UKK3 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
PARP4Q9UKK3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
PARP4Q9UKK3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.64■■■□□ 2.98
PARP4Q9UKK3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
PARP4Q9UKK3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC33.63■■■□□ 2.97
PARP4Q9UKK3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
PARP4Q9UKK3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
PARP4Q9UKK3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
PARP4Q9UKK3 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
PARP4Q9UKK3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
PARP4Q9UKK3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
PARP4Q9UKK3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
PARP4Q9UKK3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
PARP4Q9UKK3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
PARP4Q9UKK3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
PARP4Q9UKK3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
PARP4Q9UKK3 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
PARP4Q9UKK3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
PARP4Q9UKK3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
PARP4Q9UKK3 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
PARP4Q9UKK3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
PARP4Q9UKK3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
PARP4Q9UKK3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
PARP4Q9UKK3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
PARP4Q9UKK3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
PARP4Q9UKK3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
PARP4Q9UKK3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
PARP4Q9UKK3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
PARP4Q9UKK3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
PARP4Q9UKK3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
PARP4Q9UKK3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
PARP4Q9UKK3 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
PARP4Q9UKK3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
PARP4Q9UKK3 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
PARP4Q9UKK3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
PARP4Q9UKK3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
PARP4Q9UKK3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
PARP4Q9UKK3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
PARP4Q9UKK3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.96
PARP4Q9UKK3 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
PARP4Q9UKK3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC33.51■■■□□ 2.96
PARP4Q9UKK3 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
PARP4Q9UKK3 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC33.5■■■□□ 2.95
PARP4Q9UKK3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
PARP4Q9UKK3 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC33.49■■■□□ 2.95
PARP4Q9UKK3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
PARP4Q9UKK3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC33.49■■■□□ 2.95
PARP4Q9UKK3 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
PARP4Q9UKK3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms