Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKG1

APPL1, DCC-interacting protein 13-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APPL1Q9UKG1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
APPL1Q9UKG1 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
APPL1Q9UKG1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
APPL1Q9UKG1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
APPL1Q9UKG1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
APPL1Q9UKG1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
APPL1Q9UKG1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
APPL1Q9UKG1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
APPL1Q9UKG1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
APPL1Q9UKG1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
APPL1Q9UKG1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
APPL1Q9UKG1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
APPL1Q9UKG1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
APPL1Q9UKG1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
APPL1Q9UKG1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
APPL1Q9UKG1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
APPL1Q9UKG1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
APPL1Q9UKG1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
APPL1Q9UKG1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
APPL1Q9UKG1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
APPL1Q9UKG1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
APPL1Q9UKG1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
APPL1Q9UKG1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
APPL1Q9UKG1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
APPL1Q9UKG1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
APPL1Q9UKG1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
APPL1Q9UKG1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
APPL1Q9UKG1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
APPL1Q9UKG1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
APPL1Q9UKG1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
APPL1Q9UKG1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
APPL1Q9UKG1 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
APPL1Q9UKG1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
APPL1Q9UKG1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
APPL1Q9UKG1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
APPL1Q9UKG1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
APPL1Q9UKG1 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
APPL1Q9UKG1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
APPL1Q9UKG1 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
APPL1Q9UKG1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
APPL1Q9UKG1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
APPL1Q9UKG1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
APPL1Q9UKG1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
APPL1Q9UKG1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
APPL1Q9UKG1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
APPL1Q9UKG1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
APPL1Q9UKG1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
APPL1Q9UKG1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
APPL1Q9UKG1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
APPL1Q9UKG1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
APPL1Q9UKG1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
APPL1Q9UKG1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
APPL1Q9UKG1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
APPL1Q9UKG1 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
APPL1Q9UKG1 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
APPL1Q9UKG1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
APPL1Q9UKG1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
APPL1Q9UKG1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
APPL1Q9UKG1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
APPL1Q9UKG1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
APPL1Q9UKG1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
APPL1Q9UKG1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
APPL1Q9UKG1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
APPL1Q9UKG1 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
APPL1Q9UKG1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
APPL1Q9UKG1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
APPL1Q9UKG1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
APPL1Q9UKG1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
APPL1Q9UKG1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
APPL1Q9UKG1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
APPL1Q9UKG1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
APPL1Q9UKG1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
APPL1Q9UKG1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
APPL1Q9UKG1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
APPL1Q9UKG1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
APPL1Q9UKG1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
APPL1Q9UKG1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
APPL1Q9UKG1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
APPL1Q9UKG1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
APPL1Q9UKG1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
APPL1Q9UKG1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
APPL1Q9UKG1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
APPL1Q9UKG1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
APPL1Q9UKG1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
APPL1Q9UKG1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
APPL1Q9UKG1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
APPL1Q9UKG1 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
APPL1Q9UKG1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
APPL1Q9UKG1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
APPL1Q9UKG1 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
APPL1Q9UKG1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
APPL1Q9UKG1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
APPL1Q9UKG1 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
APPL1Q9UKG1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
APPL1Q9UKG1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
APPL1Q9UKG1 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
APPL1Q9UKG1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
APPL1Q9UKG1 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
APPL1Q9UKG1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
APPL1Q9UKG1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 134.9 ms