Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA9

PTBP2, Polypyrimidine tract-binding protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTBP2Q9UKA9 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTBP2Q9UKA9 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTBP2Q9UKA9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTBP2Q9UKA9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTBP2Q9UKA9 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTBP2Q9UKA9 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTBP2Q9UKA9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTBP2Q9UKA9 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTBP2Q9UKA9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PTBP2Q9UKA9 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTBP2Q9UKA9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTBP2Q9UKA9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTBP2Q9UKA9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTBP2Q9UKA9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTBP2Q9UKA9 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTBP2Q9UKA9 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTBP2Q9UKA9 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTBP2Q9UKA9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTBP2Q9UKA9 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTBP2Q9UKA9 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTBP2Q9UKA9 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTBP2Q9UKA9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTBP2Q9UKA9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTBP2Q9UKA9 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTBP2Q9UKA9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTBP2Q9UKA9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTBP2Q9UKA9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTBP2Q9UKA9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTBP2Q9UKA9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTBP2Q9UKA9 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTBP2Q9UKA9 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTBP2Q9UKA9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTBP2Q9UKA9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTBP2Q9UKA9 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTBP2Q9UKA9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTBP2Q9UKA9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTBP2Q9UKA9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTBP2Q9UKA9 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTBP2Q9UKA9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTBP2Q9UKA9 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTBP2Q9UKA9 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTBP2Q9UKA9 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTBP2Q9UKA9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTBP2Q9UKA9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTBP2Q9UKA9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTBP2Q9UKA9 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTBP2Q9UKA9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTBP2Q9UKA9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTBP2Q9UKA9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTBP2Q9UKA9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTBP2Q9UKA9 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTBP2Q9UKA9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTBP2Q9UKA9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTBP2Q9UKA9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTBP2Q9UKA9 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTBP2Q9UKA9 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTBP2Q9UKA9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTBP2Q9UKA9 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PTBP2Q9UKA9 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PTBP2Q9UKA9 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTBP2Q9UKA9 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTBP2Q9UKA9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTBP2Q9UKA9 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTBP2Q9UKA9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTBP2Q9UKA9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTBP2Q9UKA9 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTBP2Q9UKA9 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTBP2Q9UKA9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTBP2Q9UKA9 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTBP2Q9UKA9 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTBP2Q9UKA9 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTBP2Q9UKA9 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTBP2Q9UKA9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTBP2Q9UKA9 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTBP2Q9UKA9 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTBP2Q9UKA9 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTBP2Q9UKA9 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PTBP2Q9UKA9 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTBP2Q9UKA9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTBP2Q9UKA9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTBP2Q9UKA9 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTBP2Q9UKA9 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTBP2Q9UKA9 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTBP2Q9UKA9 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTBP2Q9UKA9 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTBP2Q9UKA9 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTBP2Q9UKA9 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTBP2Q9UKA9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTBP2Q9UKA9 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTBP2Q9UKA9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTBP2Q9UKA9 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTBP2Q9UKA9 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTBP2Q9UKA9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTBP2Q9UKA9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTBP2Q9UKA9 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTBP2Q9UKA9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTBP2Q9UKA9 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTBP2Q9UKA9 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTBP2Q9UKA9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTBP2Q9UKA9 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms