Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJQ7

SCP2D1, SCP2 sterol-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCP2D1Q9UJQ7 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCP2D1Q9UJQ7 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCP2D1Q9UJQ7 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCP2D1Q9UJQ7 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCP2D1Q9UJQ7 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCP2D1Q9UJQ7 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCP2D1Q9UJQ7 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCP2D1Q9UJQ7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCP2D1Q9UJQ7 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCP2D1Q9UJQ7 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCP2D1Q9UJQ7 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SCP2D1Q9UJQ7 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCP2D1Q9UJQ7 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCP2D1Q9UJQ7 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCP2D1Q9UJQ7 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCP2D1Q9UJQ7 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCP2D1Q9UJQ7 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCP2D1Q9UJQ7 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCP2D1Q9UJQ7 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCP2D1Q9UJQ7 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCP2D1Q9UJQ7 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCP2D1Q9UJQ7 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCP2D1Q9UJQ7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCP2D1Q9UJQ7 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCP2D1Q9UJQ7 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCP2D1Q9UJQ7 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCP2D1Q9UJQ7 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCP2D1Q9UJQ7 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCP2D1Q9UJQ7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCP2D1Q9UJQ7 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCP2D1Q9UJQ7 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCP2D1Q9UJQ7 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCP2D1Q9UJQ7 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCP2D1Q9UJQ7 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCP2D1Q9UJQ7 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCP2D1Q9UJQ7 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCP2D1Q9UJQ7 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCP2D1Q9UJQ7 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCP2D1Q9UJQ7 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCP2D1Q9UJQ7 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCP2D1Q9UJQ7 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCP2D1Q9UJQ7 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCP2D1Q9UJQ7 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCP2D1Q9UJQ7 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCP2D1Q9UJQ7 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCP2D1Q9UJQ7 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCP2D1Q9UJQ7 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCP2D1Q9UJQ7 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCP2D1Q9UJQ7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCP2D1Q9UJQ7 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SCP2D1Q9UJQ7 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SCP2D1Q9UJQ7 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SCP2D1Q9UJQ7 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
SCP2D1Q9UJQ7 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SCP2D1Q9UJQ7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SCP2D1Q9UJQ7 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SCP2D1Q9UJQ7 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SCP2D1Q9UJQ7 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SCP2D1Q9UJQ7 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SCP2D1Q9UJQ7 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SCP2D1Q9UJQ7 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SCP2D1Q9UJQ7 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SCP2D1Q9UJQ7 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SCP2D1Q9UJQ7 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SCP2D1Q9UJQ7 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SCP2D1Q9UJQ7 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SCP2D1Q9UJQ7 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SCP2D1Q9UJQ7 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SCP2D1Q9UJQ7 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SCP2D1Q9UJQ7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SCP2D1Q9UJQ7 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SCP2D1Q9UJQ7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SCP2D1Q9UJQ7 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SCP2D1Q9UJQ7 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SCP2D1Q9UJQ7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SCP2D1Q9UJQ7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCP2D1Q9UJQ7 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCP2D1Q9UJQ7 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCP2D1Q9UJQ7 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCP2D1Q9UJQ7 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCP2D1Q9UJQ7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCP2D1Q9UJQ7 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCP2D1Q9UJQ7 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCP2D1Q9UJQ7 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCP2D1Q9UJQ7 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCP2D1Q9UJQ7 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCP2D1Q9UJQ7 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCP2D1Q9UJQ7 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCP2D1Q9UJQ7 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCP2D1Q9UJQ7 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCP2D1Q9UJQ7 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCP2D1Q9UJQ7 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SCP2D1Q9UJQ7 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SCP2D1Q9UJQ7 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SCP2D1Q9UJQ7 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SCP2D1Q9UJQ7 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SCP2D1Q9UJQ7 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
SCP2D1Q9UJQ7 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SCP2D1Q9UJQ7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SCP2D1Q9UJQ7 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79 ms