Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ98

STAG3, Cohesin subunit SA-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAG3Q9UJ98 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC36.81■■■■□ 3.48
STAG3Q9UJ98 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC36.8■■■■□ 3.48
STAG3Q9UJ98 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
STAG3Q9UJ98 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
STAG3Q9UJ98 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
STAG3Q9UJ98 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
STAG3Q9UJ98 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
STAG3Q9UJ98 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC36.78■■■■□ 3.48
STAG3Q9UJ98 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC36.78■■■■□ 3.48
STAG3Q9UJ98 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
STAG3Q9UJ98 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
STAG3Q9UJ98 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
STAG3Q9UJ98 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC36.77■■■■□ 3.48
STAG3Q9UJ98 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC36.77■■■■□ 3.48
STAG3Q9UJ98 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
STAG3Q9UJ98 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
STAG3Q9UJ98 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC36.75■■■■□ 3.47
STAG3Q9UJ98 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
STAG3Q9UJ98 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
STAG3Q9UJ98 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC36.73■■■■□ 3.47
STAG3Q9UJ98 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC36.73■■■■□ 3.47
STAG3Q9UJ98 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC36.72■■■■□ 3.47
STAG3Q9UJ98 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
STAG3Q9UJ98 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
STAG3Q9UJ98 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
STAG3Q9UJ98 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.47
STAG3Q9UJ98 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
STAG3Q9UJ98 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
STAG3Q9UJ98 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
STAG3Q9UJ98 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC36.68■■■■□ 3.46
STAG3Q9UJ98 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
STAG3Q9UJ98 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
STAG3Q9UJ98 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC36.68■■■■□ 3.46
STAG3Q9UJ98 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC36.67■■■■□ 3.46
STAG3Q9UJ98 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
STAG3Q9UJ98 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
STAG3Q9UJ98 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.65■■■■□ 3.46
STAG3Q9UJ98 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
STAG3Q9UJ98 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
STAG3Q9UJ98 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
STAG3Q9UJ98 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
STAG3Q9UJ98 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
STAG3Q9UJ98 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.62■■■■□ 3.45
STAG3Q9UJ98 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC36.62■■■■□ 3.45
STAG3Q9UJ98 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
STAG3Q9UJ98 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45
STAG3Q9UJ98 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
STAG3Q9UJ98 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
STAG3Q9UJ98 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
STAG3Q9UJ98 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
STAG3Q9UJ98 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
STAG3Q9UJ98 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
STAG3Q9UJ98 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
STAG3Q9UJ98 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC36.59■■■■□ 3.45
STAG3Q9UJ98 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC36.59■■■■□ 3.45
STAG3Q9UJ98 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC36.57■■■■□ 3.45
STAG3Q9UJ98 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC36.57■■■■□ 3.44
STAG3Q9UJ98 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.55■■■■□ 3.44
STAG3Q9UJ98 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
STAG3Q9UJ98 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC36.55■■■■□ 3.44
STAG3Q9UJ98 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
STAG3Q9UJ98 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
STAG3Q9UJ98 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
STAG3Q9UJ98 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
STAG3Q9UJ98 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
STAG3Q9UJ98 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
STAG3Q9UJ98 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
STAG3Q9UJ98 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
STAG3Q9UJ98 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
STAG3Q9UJ98 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC36.52■■■■□ 3.44
STAG3Q9UJ98 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC36.52■■■■□ 3.44
STAG3Q9UJ98 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC36.52■■■■□ 3.44
STAG3Q9UJ98 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
STAG3Q9UJ98 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
STAG3Q9UJ98 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
STAG3Q9UJ98 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
STAG3Q9UJ98 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
STAG3Q9UJ98 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
STAG3Q9UJ98 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.44
STAG3Q9UJ98 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
STAG3Q9UJ98 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
STAG3Q9UJ98 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
STAG3Q9UJ98 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC36.49■■■■□ 3.43
STAG3Q9UJ98 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
STAG3Q9UJ98 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC36.49■■■■□ 3.43
STAG3Q9UJ98 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC36.48■■■■□ 3.43
STAG3Q9UJ98 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
STAG3Q9UJ98 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC36.48■■■■□ 3.43
STAG3Q9UJ98 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
STAG3Q9UJ98 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
STAG3Q9UJ98 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
STAG3Q9UJ98 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC36.46■■■■□ 3.43
STAG3Q9UJ98 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC36.46■■■■□ 3.43
STAG3Q9UJ98 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.43
STAG3Q9UJ98 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
STAG3Q9UJ98 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
STAG3Q9UJ98 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
STAG3Q9UJ98 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
STAG3Q9UJ98 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
STAG3Q9UJ98 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC36.44■■■■□ 3.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms