Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RABGEF1Q9UJ41 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RABGEF1Q9UJ41 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RABGEF1Q9UJ41 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RABGEF1Q9UJ41 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RABGEF1Q9UJ41 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RABGEF1Q9UJ41 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RABGEF1Q9UJ41 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RABGEF1Q9UJ41 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RABGEF1Q9UJ41 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RABGEF1Q9UJ41 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RABGEF1Q9UJ41 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RABGEF1Q9UJ41 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RABGEF1Q9UJ41 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RABGEF1Q9UJ41 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RABGEF1Q9UJ41 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RABGEF1Q9UJ41 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RABGEF1Q9UJ41 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RABGEF1Q9UJ41 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RABGEF1Q9UJ41 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RABGEF1Q9UJ41 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RABGEF1Q9UJ41 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
RABGEF1Q9UJ41 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RABGEF1Q9UJ41 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RABGEF1Q9UJ41 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RABGEF1Q9UJ41 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RABGEF1Q9UJ41 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RABGEF1Q9UJ41 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RABGEF1Q9UJ41 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
RABGEF1Q9UJ41 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
RABGEF1Q9UJ41 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
RABGEF1Q9UJ41 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RABGEF1Q9UJ41 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RABGEF1Q9UJ41 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RABGEF1Q9UJ41 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RABGEF1Q9UJ41 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
RABGEF1Q9UJ41 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RABGEF1Q9UJ41 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RABGEF1Q9UJ41 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RABGEF1Q9UJ41 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
RABGEF1Q9UJ41 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
RABGEF1Q9UJ41 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
RABGEF1Q9UJ41 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
RABGEF1Q9UJ41 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
RABGEF1Q9UJ41 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RABGEF1Q9UJ41 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RABGEF1Q9UJ41 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RABGEF1Q9UJ41 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RABGEF1Q9UJ41 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RABGEF1Q9UJ41 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
RABGEF1Q9UJ41 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
RABGEF1Q9UJ41 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
RABGEF1Q9UJ41 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RABGEF1Q9UJ41 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RABGEF1Q9UJ41 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RABGEF1Q9UJ41 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
RABGEF1Q9UJ41 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RABGEF1Q9UJ41 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RABGEF1Q9UJ41 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RABGEF1Q9UJ41 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RABGEF1Q9UJ41 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RABGEF1Q9UJ41 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RABGEF1Q9UJ41 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RABGEF1Q9UJ41 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RABGEF1Q9UJ41 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RABGEF1Q9UJ41 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RABGEF1Q9UJ41 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RABGEF1Q9UJ41 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RABGEF1Q9UJ41 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RABGEF1Q9UJ41 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RABGEF1Q9UJ41 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RABGEF1Q9UJ41 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RABGEF1Q9UJ41 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RABGEF1Q9UJ41 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RABGEF1Q9UJ41 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RABGEF1Q9UJ41 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RABGEF1Q9UJ41 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RABGEF1Q9UJ41 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RABGEF1Q9UJ41 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RABGEF1Q9UJ41 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RABGEF1Q9UJ41 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RABGEF1Q9UJ41 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RABGEF1Q9UJ41 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RABGEF1Q9UJ41 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RABGEF1Q9UJ41 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RABGEF1Q9UJ41 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RABGEF1Q9UJ41 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RABGEF1Q9UJ41 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RABGEF1Q9UJ41 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RABGEF1Q9UJ41 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RABGEF1Q9UJ41 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RABGEF1Q9UJ41 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RABGEF1Q9UJ41 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RABGEF1Q9UJ41 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RABGEF1Q9UJ41 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
RABGEF1Q9UJ41 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RABGEF1Q9UJ41 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RABGEF1Q9UJ41 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RABGEF1Q9UJ41 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
RABGEF1Q9UJ41 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
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