Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI09

NDUFA12, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 12, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA12Q9UI09 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NDUFA12Q9UI09 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NDUFA12Q9UI09 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NDUFA12Q9UI09 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NDUFA12Q9UI09 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NDUFA12Q9UI09 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NDUFA12Q9UI09 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NDUFA12Q9UI09 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NDUFA12Q9UI09 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NDUFA12Q9UI09 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NDUFA12Q9UI09 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NDUFA12Q9UI09 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NDUFA12Q9UI09 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
NDUFA12Q9UI09 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NDUFA12Q9UI09 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NDUFA12Q9UI09 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NDUFA12Q9UI09 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NDUFA12Q9UI09 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NDUFA12Q9UI09 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NDUFA12Q9UI09 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NDUFA12Q9UI09 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NDUFA12Q9UI09 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NDUFA12Q9UI09 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NDUFA12Q9UI09 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NDUFA12Q9UI09 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NDUFA12Q9UI09 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NDUFA12Q9UI09 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NDUFA12Q9UI09 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NDUFA12Q9UI09 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NDUFA12Q9UI09 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NDUFA12Q9UI09 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NDUFA12Q9UI09 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NDUFA12Q9UI09 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NDUFA12Q9UI09 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NDUFA12Q9UI09 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NDUFA12Q9UI09 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NDUFA12Q9UI09 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NDUFA12Q9UI09 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NDUFA12Q9UI09 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
NDUFA12Q9UI09 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NDUFA12Q9UI09 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NDUFA12Q9UI09 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NDUFA12Q9UI09 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NDUFA12Q9UI09 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NDUFA12Q9UI09 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NDUFA12Q9UI09 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NDUFA12Q9UI09 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NDUFA12Q9UI09 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NDUFA12Q9UI09 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NDUFA12Q9UI09 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NDUFA12Q9UI09 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NDUFA12Q9UI09 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
NDUFA12Q9UI09 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NDUFA12Q9UI09 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NDUFA12Q9UI09 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NDUFA12Q9UI09 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NDUFA12Q9UI09 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NDUFA12Q9UI09 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NDUFA12Q9UI09 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NDUFA12Q9UI09 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NDUFA12Q9UI09 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NDUFA12Q9UI09 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NDUFA12Q9UI09 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NDUFA12Q9UI09 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NDUFA12Q9UI09 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NDUFA12Q9UI09 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NDUFA12Q9UI09 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NDUFA12Q9UI09 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NDUFA12Q9UI09 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NDUFA12Q9UI09 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NDUFA12Q9UI09 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NDUFA12Q9UI09 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NDUFA12Q9UI09 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
NDUFA12Q9UI09 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NDUFA12Q9UI09 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NDUFA12Q9UI09 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NDUFA12Q9UI09 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NDUFA12Q9UI09 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NDUFA12Q9UI09 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NDUFA12Q9UI09 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NDUFA12Q9UI09 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NDUFA12Q9UI09 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NDUFA12Q9UI09 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NDUFA12Q9UI09 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NDUFA12Q9UI09 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
NDUFA12Q9UI09 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NDUFA12Q9UI09 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NDUFA12Q9UI09 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NDUFA12Q9UI09 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NDUFA12Q9UI09 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
NDUFA12Q9UI09 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NDUFA12Q9UI09 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NDUFA12Q9UI09 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NDUFA12Q9UI09 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NDUFA12Q9UI09 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NDUFA12Q9UI09 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NDUFA12Q9UI09 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NDUFA12Q9UI09 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NDUFA12Q9UI09 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NDUFA12Q9UI09 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 160.6 ms