Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB9

TFIP11, Tuftelin-interacting protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFIP11Q9UBB9 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
TFIP11Q9UBB9 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
TFIP11Q9UBB9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TFIP11Q9UBB9 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
TFIP11Q9UBB9 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TFIP11Q9UBB9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TFIP11Q9UBB9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TFIP11Q9UBB9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TFIP11Q9UBB9 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TFIP11Q9UBB9 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
TFIP11Q9UBB9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TFIP11Q9UBB9 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TFIP11Q9UBB9 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TFIP11Q9UBB9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TFIP11Q9UBB9 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TFIP11Q9UBB9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TFIP11Q9UBB9 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TFIP11Q9UBB9 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TFIP11Q9UBB9 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TFIP11Q9UBB9 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TFIP11Q9UBB9 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TFIP11Q9UBB9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TFIP11Q9UBB9 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TFIP11Q9UBB9 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
TFIP11Q9UBB9 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
TFIP11Q9UBB9 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TFIP11Q9UBB9 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TFIP11Q9UBB9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TFIP11Q9UBB9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TFIP11Q9UBB9 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TFIP11Q9UBB9 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TFIP11Q9UBB9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TFIP11Q9UBB9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TFIP11Q9UBB9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TFIP11Q9UBB9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TFIP11Q9UBB9 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TFIP11Q9UBB9 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
TFIP11Q9UBB9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TFIP11Q9UBB9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TFIP11Q9UBB9 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TFIP11Q9UBB9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TFIP11Q9UBB9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TFIP11Q9UBB9 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TFIP11Q9UBB9 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TFIP11Q9UBB9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TFIP11Q9UBB9 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TFIP11Q9UBB9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TFIP11Q9UBB9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TFIP11Q9UBB9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TFIP11Q9UBB9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TFIP11Q9UBB9 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TFIP11Q9UBB9 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TFIP11Q9UBB9 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TFIP11Q9UBB9 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TFIP11Q9UBB9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TFIP11Q9UBB9 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TFIP11Q9UBB9 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TFIP11Q9UBB9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TFIP11Q9UBB9 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TFIP11Q9UBB9 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
TFIP11Q9UBB9 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TFIP11Q9UBB9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TFIP11Q9UBB9 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TFIP11Q9UBB9 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TFIP11Q9UBB9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TFIP11Q9UBB9 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TFIP11Q9UBB9 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TFIP11Q9UBB9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TFIP11Q9UBB9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TFIP11Q9UBB9 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TFIP11Q9UBB9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TFIP11Q9UBB9 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TFIP11Q9UBB9 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TFIP11Q9UBB9 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TFIP11Q9UBB9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TFIP11Q9UBB9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TFIP11Q9UBB9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TFIP11Q9UBB9 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TFIP11Q9UBB9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TFIP11Q9UBB9 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TFIP11Q9UBB9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TFIP11Q9UBB9 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TFIP11Q9UBB9 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TFIP11Q9UBB9 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TFIP11Q9UBB9 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TFIP11Q9UBB9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TFIP11Q9UBB9 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TFIP11Q9UBB9 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TFIP11Q9UBB9 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
TFIP11Q9UBB9 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
TFIP11Q9UBB9 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TFIP11Q9UBB9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TFIP11Q9UBB9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
TFIP11Q9UBB9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TFIP11Q9UBB9 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TFIP11Q9UBB9 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TFIP11Q9UBB9 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TFIP11Q9UBB9 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TFIP11Q9UBB9 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TFIP11Q9UBB9 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms