Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB5

MBD2, Methyl-CpG-binding domain protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD2Q9UBB5 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
MBD2Q9UBB5 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MBD2Q9UBB5 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
MBD2Q9UBB5 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MBD2Q9UBB5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MBD2Q9UBB5 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MBD2Q9UBB5 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MBD2Q9UBB5 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MBD2Q9UBB5 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MBD2Q9UBB5 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MBD2Q9UBB5 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MBD2Q9UBB5 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MBD2Q9UBB5 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MBD2Q9UBB5 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MBD2Q9UBB5 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MBD2Q9UBB5 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MBD2Q9UBB5 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MBD2Q9UBB5 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MBD2Q9UBB5 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MBD2Q9UBB5 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MBD2Q9UBB5 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MBD2Q9UBB5 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MBD2Q9UBB5 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MBD2Q9UBB5 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MBD2Q9UBB5 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MBD2Q9UBB5 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MBD2Q9UBB5 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MBD2Q9UBB5 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MBD2Q9UBB5 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MBD2Q9UBB5 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MBD2Q9UBB5 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
MBD2Q9UBB5 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
MBD2Q9UBB5 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
MBD2Q9UBB5 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
MBD2Q9UBB5 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
MBD2Q9UBB5 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
MBD2Q9UBB5 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MBD2Q9UBB5 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MBD2Q9UBB5 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MBD2Q9UBB5 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MBD2Q9UBB5 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
MBD2Q9UBB5 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
MBD2Q9UBB5 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
MBD2Q9UBB5 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
MBD2Q9UBB5 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
MBD2Q9UBB5 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MBD2Q9UBB5 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
MBD2Q9UBB5 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MBD2Q9UBB5 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
MBD2Q9UBB5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
MBD2Q9UBB5 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
MBD2Q9UBB5 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
MBD2Q9UBB5 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
MBD2Q9UBB5 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
MBD2Q9UBB5 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
MBD2Q9UBB5 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
MBD2Q9UBB5 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
MBD2Q9UBB5 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
MBD2Q9UBB5 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MBD2Q9UBB5 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
MBD2Q9UBB5 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MBD2Q9UBB5 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MBD2Q9UBB5 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MBD2Q9UBB5 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
MBD2Q9UBB5 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MBD2Q9UBB5 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
MBD2Q9UBB5 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MBD2Q9UBB5 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
MBD2Q9UBB5 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
MBD2Q9UBB5 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
MBD2Q9UBB5 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MBD2Q9UBB5 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MBD2Q9UBB5 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
MBD2Q9UBB5 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MBD2Q9UBB5 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MBD2Q9UBB5 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
MBD2Q9UBB5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MBD2Q9UBB5 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MBD2Q9UBB5 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
MBD2Q9UBB5 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MBD2Q9UBB5 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MBD2Q9UBB5 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MBD2Q9UBB5 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MBD2Q9UBB5 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MBD2Q9UBB5 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MBD2Q9UBB5 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MBD2Q9UBB5 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MBD2Q9UBB5 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MBD2Q9UBB5 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MBD2Q9UBB5 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MBD2Q9UBB5 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MBD2Q9UBB5 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MBD2Q9UBB5 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MBD2Q9UBB5 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MBD2Q9UBB5 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MBD2Q9UBB5 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MBD2Q9UBB5 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MBD2Q9UBB5 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MBD2Q9UBB5 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MBD2Q9UBB5 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms