Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1R0

Lhx6, LIM/homeobox protein Lhx6, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx6Q9R1R0 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lhx6Q9R1R0 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lhx6Q9R1R0 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lhx6Q9R1R0 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lhx6Q9R1R0 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lhx6Q9R1R0 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lhx6Q9R1R0 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lhx6Q9R1R0 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lhx6Q9R1R0 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lhx6Q9R1R0 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lhx6Q9R1R0 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lhx6Q9R1R0 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Lhx6Q9R1R0 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Lhx6Q9R1R0 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lhx6Q9R1R0 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Lhx6Q9R1R0 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lhx6Q9R1R0 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lhx6Q9R1R0 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lhx6Q9R1R0 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Lhx6Q9R1R0 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lhx6Q9R1R0 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lhx6Q9R1R0 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lhx6Q9R1R0 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Lhx6Q9R1R0 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lhx6Q9R1R0 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lhx6Q9R1R0 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Lhx6Q9R1R0 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lhx6Q9R1R0 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Lhx6Q9R1R0 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lhx6Q9R1R0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lhx6Q9R1R0 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Lhx6Q9R1R0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lhx6Q9R1R0 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Lhx6Q9R1R0 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lhx6Q9R1R0 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lhx6Q9R1R0 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lhx6Q9R1R0 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lhx6Q9R1R0 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lhx6Q9R1R0 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lhx6Q9R1R0 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Lhx6Q9R1R0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Lhx6Q9R1R0 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Lhx6Q9R1R0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Lhx6Q9R1R0 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lhx6Q9R1R0 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Lhx6Q9R1R0 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lhx6Q9R1R0 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lhx6Q9R1R0 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lhx6Q9R1R0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Lhx6Q9R1R0 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lhx6Q9R1R0 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lhx6Q9R1R0 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lhx6Q9R1R0 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Lhx6Q9R1R0 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Lhx6Q9R1R0 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Lhx6Q9R1R0 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Lhx6Q9R1R0 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lhx6Q9R1R0 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lhx6Q9R1R0 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Lhx6Q9R1R0 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lhx6Q9R1R0 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lhx6Q9R1R0 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Lhx6Q9R1R0 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Lhx6Q9R1R0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lhx6Q9R1R0 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lhx6Q9R1R0 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Lhx6Q9R1R0 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lhx6Q9R1R0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lhx6Q9R1R0 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lhx6Q9R1R0 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Lhx6Q9R1R0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Lhx6Q9R1R0 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lhx6Q9R1R0 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lhx6Q9R1R0 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lhx6Q9R1R0 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lhx6Q9R1R0 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lhx6Q9R1R0 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lhx6Q9R1R0 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lhx6Q9R1R0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lhx6Q9R1R0 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lhx6Q9R1R0 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lhx6Q9R1R0 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lhx6Q9R1R0 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lhx6Q9R1R0 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lhx6Q9R1R0 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lhx6Q9R1R0 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lhx6Q9R1R0 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lhx6Q9R1R0 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lhx6Q9R1R0 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lhx6Q9R1R0 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lhx6Q9R1R0 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lhx6Q9R1R0 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lhx6Q9R1R0 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lhx6Q9R1R0 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lhx6Q9R1R0 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lhx6Q9R1R0 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lhx6Q9R1R0 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lhx6Q9R1R0 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lhx6Q9R1R0 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lhx6Q9R1R0 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms