Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P1

Psmb3, Proteasome subunit beta type-3, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb3Q9R1P1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Psmb3Q9R1P1 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Psmb3Q9R1P1 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Psmb3Q9R1P1 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Psmb3Q9R1P1 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Psmb3Q9R1P1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Psmb3Q9R1P1 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Psmb3Q9R1P1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Psmb3Q9R1P1 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Psmb3Q9R1P1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Psmb3Q9R1P1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Psmb3Q9R1P1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Psmb3Q9R1P1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Psmb3Q9R1P1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Psmb3Q9R1P1 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19■□□□□ 0.63
Psmb3Q9R1P1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Psmb3Q9R1P1 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Psmb3Q9R1P1 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Psmb3Q9R1P1 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Psmb3Q9R1P1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Psmb3Q9R1P1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Psmb3Q9R1P1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Psmb3Q9R1P1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Psmb3Q9R1P1 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Psmb3Q9R1P1 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Psmb3Q9R1P1 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Psmb3Q9R1P1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Psmb3Q9R1P1 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Psmb3Q9R1P1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Psmb3Q9R1P1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Psmb3Q9R1P1 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Psmb3Q9R1P1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Psmb3Q9R1P1 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Psmb3Q9R1P1 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Psmb3Q9R1P1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Psmb3Q9R1P1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Psmb3Q9R1P1 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Psmb3Q9R1P1 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Psmb3Q9R1P1 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Psmb3Q9R1P1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Psmb3Q9R1P1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Psmb3Q9R1P1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Psmb3Q9R1P1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Psmb3Q9R1P1 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Psmb3Q9R1P1 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Psmb3Q9R1P1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Psmb3Q9R1P1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Psmb3Q9R1P1 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Psmb3Q9R1P1 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Psmb3Q9R1P1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Psmb3Q9R1P1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Psmb3Q9R1P1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Psmb3Q9R1P1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Psmb3Q9R1P1 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Psmb3Q9R1P1 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Psmb3Q9R1P1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Psmb3Q9R1P1 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Psmb3Q9R1P1 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Psmb3Q9R1P1 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Psmb3Q9R1P1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Psmb3Q9R1P1 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Psmb3Q9R1P1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Psmb3Q9R1P1 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Psmb3Q9R1P1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Psmb3Q9R1P1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Psmb3Q9R1P1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Psmb3Q9R1P1 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Psmb3Q9R1P1 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Psmb3Q9R1P1 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Psmb3Q9R1P1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Psmb3Q9R1P1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Psmb3Q9R1P1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Psmb3Q9R1P1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Psmb3Q9R1P1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Psmb3Q9R1P1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Psmb3Q9R1P1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Psmb3Q9R1P1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Psmb3Q9R1P1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Psmb3Q9R1P1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Psmb3Q9R1P1 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Psmb3Q9R1P1 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Psmb3Q9R1P1 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Psmb3Q9R1P1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Psmb3Q9R1P1 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Psmb3Q9R1P1 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Psmb3Q9R1P1 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Psmb3Q9R1P1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Psmb3Q9R1P1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Psmb3Q9R1P1 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Psmb3Q9R1P1 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Psmb3Q9R1P1 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Psmb3Q9R1P1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Psmb3Q9R1P1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Psmb3Q9R1P1 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Psmb3Q9R1P1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Psmb3Q9R1P1 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Psmb3Q9R1P1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Psmb3Q9R1P1 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Psmb3Q9R1P1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Psmb3Q9R1P1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 360.3 ms