Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0G8

Nrk, Nik-related protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrkQ9R0G8 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC38.02■■■■□ 3.68
NrkQ9R0G8 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
NrkQ9R0G8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.67
NrkQ9R0G8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
NrkQ9R0G8 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
NrkQ9R0G8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
NrkQ9R0G8 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38■■■■□ 3.67
NrkQ9R0G8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
NrkQ9R0G8 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
NrkQ9R0G8 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
NrkQ9R0G8 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC37.98■■■■□ 3.67
NrkQ9R0G8 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC37.98■■■■□ 3.67
NrkQ9R0G8 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC37.98■■■■□ 3.67
NrkQ9R0G8 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
NrkQ9R0G8 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC37.97■■■■□ 3.67
NrkQ9R0G8 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC37.97■■■■□ 3.67
NrkQ9R0G8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
NrkQ9R0G8 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
NrkQ9R0G8 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC37.95■■■■□ 3.67
NrkQ9R0G8 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC37.95■■■■□ 3.67
NrkQ9R0G8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
NrkQ9R0G8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.93■■■■□ 3.66
NrkQ9R0G8 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC37.91■■■■□ 3.66
NrkQ9R0G8 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
NrkQ9R0G8 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC37.91■■■■□ 3.66
NrkQ9R0G8 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC37.9■■■■□ 3.66
NrkQ9R0G8 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
NrkQ9R0G8 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC37.89■■■■□ 3.66
NrkQ9R0G8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
NrkQ9R0G8 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC37.87■■■■□ 3.65
NrkQ9R0G8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
NrkQ9R0G8 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
NrkQ9R0G8 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
NrkQ9R0G8 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC37.85■■■■□ 3.65
NrkQ9R0G8 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
NrkQ9R0G8 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC37.84■■■■□ 3.65
NrkQ9R0G8 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
NrkQ9R0G8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
NrkQ9R0G8 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
NrkQ9R0G8 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
NrkQ9R0G8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
NrkQ9R0G8 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC37.81■■■■□ 3.64
NrkQ9R0G8 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC37.81■■■■□ 3.64
NrkQ9R0G8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
NrkQ9R0G8 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
NrkQ9R0G8 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
NrkQ9R0G8 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
NrkQ9R0G8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC37.79■■■■□ 3.64
NrkQ9R0G8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC37.79■■■■□ 3.64
NrkQ9R0G8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.78■■■■□ 3.64
NrkQ9R0G8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
NrkQ9R0G8 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
NrkQ9R0G8 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
NrkQ9R0G8 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
NrkQ9R0G8 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC37.76■■■■□ 3.63
NrkQ9R0G8 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC37.76■■■■□ 3.63
NrkQ9R0G8 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.75■■■■□ 3.63
NrkQ9R0G8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
NrkQ9R0G8 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
NrkQ9R0G8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
NrkQ9R0G8 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
NrkQ9R0G8 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.73■■■■□ 3.63
NrkQ9R0G8 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.73■■■■□ 3.63
NrkQ9R0G8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC37.72■■■■□ 3.63
NrkQ9R0G8 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
NrkQ9R0G8 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
NrkQ9R0G8 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC37.71■■■■□ 3.63
NrkQ9R0G8 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC37.7■■■■□ 3.63
NrkQ9R0G8 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
NrkQ9R0G8 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
NrkQ9R0G8 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
NrkQ9R0G8 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
NrkQ9R0G8 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC37.68■■■■□ 3.62
NrkQ9R0G8 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
NrkQ9R0G8 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
NrkQ9R0G8 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
NrkQ9R0G8 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC37.67■■■■□ 3.62
NrkQ9R0G8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
NrkQ9R0G8 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC37.66■■■■□ 3.62
NrkQ9R0G8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
NrkQ9R0G8 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC37.66■■■■□ 3.62
NrkQ9R0G8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
NrkQ9R0G8 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
NrkQ9R0G8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
NrkQ9R0G8 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
NrkQ9R0G8 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
NrkQ9R0G8 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
NrkQ9R0G8 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
NrkQ9R0G8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
NrkQ9R0G8 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
NrkQ9R0G8 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC37.59■■■■□ 3.61
NrkQ9R0G8 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
NrkQ9R0G8 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
NrkQ9R0G8 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC37.57■■■■□ 3.6
NrkQ9R0G8 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC37.57■■■■□ 3.6
NrkQ9R0G8 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC37.57■■■■□ 3.6
NrkQ9R0G8 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
NrkQ9R0G8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.55■■■■□ 3.6
NrkQ9R0G8 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC37.55■■■■□ 3.6
NrkQ9R0G8 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.54■■■■□ 3.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 130.2 ms