Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Col4a3Q9QZS0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Col4a3Q9QZS0 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Col4a3Q9QZS0 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Col4a3Q9QZS0 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Col4a3Q9QZS0 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Col4a3Q9QZS0 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Col4a3Q9QZS0 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Col4a3Q9QZS0 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Col4a3Q9QZS0 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Col4a3Q9QZS0 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Col4a3Q9QZS0 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Col4a3Q9QZS0 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Col4a3Q9QZS0 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Col4a3Q9QZS0 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Col4a3Q9QZS0 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Col4a3Q9QZS0 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Col4a3Q9QZS0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Col4a3Q9QZS0 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Col4a3Q9QZS0 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Col4a3Q9QZS0 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Col4a3Q9QZS0 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Col4a3Q9QZS0 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Col4a3Q9QZS0 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Col4a3Q9QZS0 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Col4a3Q9QZS0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Col4a3Q9QZS0 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Col4a3Q9QZS0 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Col4a3Q9QZS0 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Col4a3Q9QZS0 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Col4a3Q9QZS0 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Col4a3Q9QZS0 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Col4a3Q9QZS0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Col4a3Q9QZS0 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Col4a3Q9QZS0 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Col4a3Q9QZS0 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Col4a3Q9QZS0 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Col4a3Q9QZS0 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Col4a3Q9QZS0 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Col4a3Q9QZS0 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Col4a3Q9QZS0 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Col4a3Q9QZS0 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Col4a3Q9QZS0 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Col4a3Q9QZS0 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Col4a3Q9QZS0 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Col4a3Q9QZS0 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Col4a3Q9QZS0 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Col4a3Q9QZS0 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Col4a3Q9QZS0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Col4a3Q9QZS0 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Col4a3Q9QZS0 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Col4a3Q9QZS0 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Col4a3Q9QZS0 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Col4a3Q9QZS0 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Col4a3Q9QZS0 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Col4a3Q9QZS0 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Col4a3Q9QZS0 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Col4a3Q9QZS0 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Col4a3Q9QZS0 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Col4a3Q9QZS0 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Col4a3Q9QZS0 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Col4a3Q9QZS0 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Col4a3Q9QZS0 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Col4a3Q9QZS0 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Col4a3Q9QZS0 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Col4a3Q9QZS0 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Col4a3Q9QZS0 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Col4a3Q9QZS0 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Col4a3Q9QZS0 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Col4a3Q9QZS0 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Col4a3Q9QZS0 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Col4a3Q9QZS0 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Col4a3Q9QZS0 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Col4a3Q9QZS0 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Col4a3Q9QZS0 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Col4a3Q9QZS0 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Col4a3Q9QZS0 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Col4a3Q9QZS0 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Col4a3Q9QZS0 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Col4a3Q9QZS0 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Col4a3Q9QZS0 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Col4a3Q9QZS0 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Col4a3Q9QZS0 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Col4a3Q9QZS0 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Col4a3Q9QZS0 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Col4a3Q9QZS0 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Col4a3Q9QZS0 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Col4a3Q9QZS0 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Col4a3Q9QZS0 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Col4a3Q9QZS0 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Col4a3Q9QZS0 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Col4a3Q9QZS0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Col4a3Q9QZS0 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Col4a3Q9QZS0 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Col4a3Q9QZS0 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Col4a3Q9QZS0 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Col4a3Q9QZS0 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Col4a3Q9QZS0 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Col4a3Q9QZS0 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Col4a3Q9QZS0 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms