Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZQ8

H2afy, Core histone macro-H2A.1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afyQ9QZQ8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
H2afyQ9QZQ8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
H2afyQ9QZQ8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
H2afyQ9QZQ8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
H2afyQ9QZQ8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
H2afyQ9QZQ8 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
H2afyQ9QZQ8 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
H2afyQ9QZQ8 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
H2afyQ9QZQ8 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
H2afyQ9QZQ8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
H2afyQ9QZQ8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
H2afyQ9QZQ8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
H2afyQ9QZQ8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
H2afyQ9QZQ8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
H2afyQ9QZQ8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
H2afyQ9QZQ8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
H2afyQ9QZQ8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
H2afyQ9QZQ8 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
H2afyQ9QZQ8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
H2afyQ9QZQ8 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
H2afyQ9QZQ8 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
H2afyQ9QZQ8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
H2afyQ9QZQ8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
H2afyQ9QZQ8 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
H2afyQ9QZQ8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
H2afyQ9QZQ8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
H2afyQ9QZQ8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
H2afyQ9QZQ8 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
H2afyQ9QZQ8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
H2afyQ9QZQ8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
H2afyQ9QZQ8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
H2afyQ9QZQ8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
H2afyQ9QZQ8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
H2afyQ9QZQ8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
H2afyQ9QZQ8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
H2afyQ9QZQ8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
H2afyQ9QZQ8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
H2afyQ9QZQ8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
H2afyQ9QZQ8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
H2afyQ9QZQ8 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
H2afyQ9QZQ8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
H2afyQ9QZQ8 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
H2afyQ9QZQ8 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
H2afyQ9QZQ8 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
H2afyQ9QZQ8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
H2afyQ9QZQ8 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
H2afyQ9QZQ8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
H2afyQ9QZQ8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
H2afyQ9QZQ8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
H2afyQ9QZQ8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
H2afyQ9QZQ8 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
H2afyQ9QZQ8 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
H2afyQ9QZQ8 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
H2afyQ9QZQ8 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
H2afyQ9QZQ8 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
H2afyQ9QZQ8 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
H2afyQ9QZQ8 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
H2afyQ9QZQ8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
H2afyQ9QZQ8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
H2afyQ9QZQ8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
H2afyQ9QZQ8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
H2afyQ9QZQ8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
H2afyQ9QZQ8 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
H2afyQ9QZQ8 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
H2afyQ9QZQ8 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
H2afyQ9QZQ8 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
H2afyQ9QZQ8 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
H2afyQ9QZQ8 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
H2afyQ9QZQ8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
H2afyQ9QZQ8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
H2afyQ9QZQ8 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
H2afyQ9QZQ8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
H2afyQ9QZQ8 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
H2afyQ9QZQ8 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
H2afyQ9QZQ8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
H2afyQ9QZQ8 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
H2afyQ9QZQ8 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
H2afyQ9QZQ8 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
H2afyQ9QZQ8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
H2afyQ9QZQ8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
H2afyQ9QZQ8 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
H2afyQ9QZQ8 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
H2afyQ9QZQ8 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
H2afyQ9QZQ8 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
H2afyQ9QZQ8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
H2afyQ9QZQ8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
H2afyQ9QZQ8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
H2afyQ9QZQ8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
H2afyQ9QZQ8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
H2afyQ9QZQ8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
H2afyQ9QZQ8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
H2afyQ9QZQ8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
H2afyQ9QZQ8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
H2afyQ9QZQ8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
H2afyQ9QZQ8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
H2afyQ9QZQ8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
H2afyQ9QZQ8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
H2afyQ9QZQ8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
H2afyQ9QZQ8 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
H2afyQ9QZQ8 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms